Merbecovirus est un sous-genre de bétacoronavirus regroupant plusieurs espèces dont le coronavirus liés au syndrome respiratoire du Moyen-Orient (MERSr-CoV)[1],[2].
La taxonomie ICTV de 2019 dénombre quatre espèces dans ce sous-genre. Ces coronavirus infectent hérissons, chauve-souris et dromadaires + humains pour le MERSr-CoV.
Le nom Merbecovirus est un acronyme agglutinant les premières syllabes de MERS-like bêta coronavirus. Les virus du sous-genre Merbecovirus étaient auparavant connus sous le nom de coronavirus du groupe 2c[3],[4].
Position phylogénétique
β-CoV
[5] Embecovirus Coronavirus humain HKU1 (HCoV HKU1)
Coronavirus murin (MCoV ou MHV)
MrufCoV 2JL14
Betacoronavirus 1 (BCoV, HCoV OC43, etc.)
ChRCoV HKU24
Merbecovirus EriCoV 1[6]
MERSr-CoV
Ty-BatCoV HKU4
Pi-BatCoV HKU5
Nobecovirus Ei-BatCoV C704
RO-BatCoV GCCDC1
RO-BatCoV HKU9
Hibecovirus Hp-betaCoV Zhejiang2013
Sarbecovirus SARSr-CoV JL2012 (chauve-souris)[7]
(…)
SARSr-CoV WIV1 (Rhinolophus sinicus)
SARSr-CoV RsSHC014 (Rhinolophus sinicus)
Civet-SARSr-CoV (civette)
SARS-CoV-1 (humain ; SRAS)
Rc-o319 (Rhinolophus cornutus, Japon)[8]
(…)
Pangolin SARSr-CoV-GX[9]
Pangolin SARSr-CoV-GD[10]
RshSTT182 (Rhinolophus shameli, Cambodge)[11]
RshSTT200 (Rhinolophus shameli, Cambodge)[11]
RacCS203 (Rhinolophus acuminatus, Thaïlande)[12]
RmYN02 (Rhinolophus malayanus, Mengla, Yunnan)[13]
RaTG13 (Rhinolophus affinis, Mojiang, Yunnan)[14]
SARS-CoV-2 (humain ; CoViD-19)
Notes et références
-
↑ a et b (en) « Virus Taxonomy: 2019 Release », ICTV, juillet 2018 (consulté le 3 avril 2021).
-
↑ (en) Antonio C. P. Wong, Xin Li, Susanna K. P. Lau et Patrick C. Y. Woo, « Global Epidemiology of Bat Coronaviruses », Viruses, vol. 11, no 2, février 2019, article no 174 (PMID , PMCID , DOI , lire en ligne)
-
↑ (en) Patrick C. Y. Woo, Ming Wang, Susanna K. P. Lau et Huifang Xu, « Comparative Analysis of Twelve Genomes of Three Novel Group 2c and Group 2d Coronaviruses Reveals Unique Group and Subgroup Features », Journal of Virology, vol. 81, no 4, 15 février 2007, p. 1574–1585 (ISSN et , PMID , PMCID , DOI , lire en ligne, consulté le 31 mars 2021)
-
↑ Antonio C. P. Wong, Xin Li, Susanna K. P. Lau et Patrick C. Y. Woo, « Global Epidemiology of Bat Coronaviruses », Viruses, vol. 11, no 2, 20 février 2019, p. 174 (ISSN , PMID , PMCID , DOI )
-
↑
-
↑
-
↑
-
↑ Shin Murakami, Tomoya Kitamura, Jin Suzuki, Ryouta Sato, Toshiki Aoi, Marina Fujii, Hiromichi Matsugo, Haruhiko Kamiki, Hiroho Ishida, Akiko Takenaka-Uema, Masayuki Shimojima et Taisuke Horimoto, « Detection and Characterization of Bat Sarbecovirus Phylogenetically Related to SARS-CoV-2, Japan », Emerging Infectious Diseases, vol. 26, no 12, décembre 2020, p. 3025–3029 (DOI )
-
↑ Tommy Tsan-Yuk Lam, Na Jia, Ya-Wei Zhang, Marcus Ho-Hin Shum, Jia-Fu Jiang, Hua-Chen Zhu, Yi-Gang Tong, Yong-Xia Shi, Xue-Bing Ni, Yun-Shi Liao, Wen-Juan Li, Bao-Gui Jiang, Wei Wei, Ting-Ting Yuan, Kui Zheng, Xiao-Ming Cui, Jie Li, Guang-Qian Pei, Xin Qiang, William Yiu-Man Cheung, Lian-Feng Li, Fang-Fang Sun, Si Qin, Ji-Cheng Huang, Gabriel M. Leung, Edward C. Holmes, Yan-Ling Hu, Yi Guan et Wu-Chun Cao, « Identifying SARS-CoV-2-related coronaviruses in Malayan pangolins », Nature, vol. 583, no 7815, 9 juillet 2020, p. 282–285 (DOI )
-
↑ Ping Liu, Jing-Zhe Jiang, Xiu-Feng Wan, Yan Hua, Linmiao Li, Jiabin Zhou, Xiaohu Wang, Fanghui Hou, Jing Chen, Jiejian Zou et Jinping Chen, « Are pangolins the intermediate host of the 2019 novel coronavirus (SARS-CoV-2)? », PLOS Pathogens, vol. 16, no 5, 14 mai 2020, e1008421 (DOI )
-
↑ a et b (en) Vibol Hul, Deborah Delaune, Erik A. Karlsson, Alexandre Hassanin, Putita Ou Tey, Artem Baidaliuk, Fabiana Gámbaro, Vuong Tan Tu, Lucy Keatts, Jonna Mazet, Christine Johnson, Philippe Buchy, Philippe Dussart, Tracey Goldstein, Etienne Simon-Lorière et Veasna Duong, « A novel SARS-CoV-2 related coronavirus in bats from Cambodia », sur bioRxiv, 26 janvier 2021 (DOI ), p. 2021.01.26.428212
-
↑ S Wacharapluesadee, CW Tan, P Maneeorn, P Duengkae, F Zhu, Y Joyjinda, T Kaewpom, WN Chia, W Ampoot, BL Lim, K Worachotsueptrakun, VC Chen, N Sirichan, C Ruchisrisarod, A Rodpan, K Noradechanon, T Phaichana, N Jantarat, B Thongnumchaima, C Tu, G Crameri, MM Stokes, T Hemachudha et LF Wang, « Evidence for SARS-CoV-2 related coronaviruses circulating in bats and pangolins in Southeast Asia. », Nature Communications, vol. 12, no 1, 9 février 2021, p. 972 (PMID , PMCID , DOI )
-
↑ H Zhou, X Chen, T Hu, J Li, H Song, Y Liu, P Wang, D Liu, J Yang, EC Holmes, AC Hughes, Y Bi et W Shi, « A Novel Bat Coronavirus Closely Related to SARS-CoV-2 Contains Natural Insertions at the S1/S2 Cleavage Site of the Spike Protein. », Current biology : CB, vol. 30, no 11, 8 juin 2020, p. 2196-2203.e3 (PMID , DOI )
-
↑ « Addendum: A pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat origin », Nature, vol. 588, no 7836, décembre 2020, E6 (PMID , DOI , lire en ligne)
