Potexvirus ist eine Gattung von Viren in der Ordnung Tymovirales, in der Familie Alphaflexiviridae. Als natürliche Wirte dienen Pflanzen.
Anfang April 2021 gab es 38 Spezies (Arten) in dieser Gattung, einschließlich der Typusart Kartoffelvirus X (engl. Potato virus X). Zu den Krankheiten, die mit dieser Gattung assoziiert werden, gehören Mosaik- und Ringspot-Symptome.[2][1]
Der Gattungsname leitet sich ab von der englischen Bezeichnung der Typusart Potato Virus X und der Endung -virus für Virusgattungen.
Die Virionen (Viruspartikel) in der Gattung Potexvirus sind nicht umhüllt, filamentös (fadenförmig) biegsam mit helikale Symmetrie. Ihre Länge kann stark variieren, zwischen 470 und 1000 nm (Nanometer) oder mehr; der Durchmesser beträgt etwa 12–13 nm. Die Ganghöhe der Helix beträgt 3,3–3,7 nm. Das Kapsid besteht aus 1000–1500 Kopien (Monomeren) des Kapsidproteins (CP) mit 8–9 Monomeren pro Windung.[2]
Das Genom ist unsegmentiert (monopartit), linear, und besteht aus einem Einzelstrang-RNA-Molekül positiver Polarität mit einer Länge von 5,9–7,0 kb (Kilobasen) lang. Das 5'-Ende hat eine Cap-Struktur, das 3'-Ende ist polyadenyliert. Das Genom kodiert für 5 Proteine. Vom 5'-Ende zum 3'-Ende hin sind diese Proteine:[2]
Durch Übersetzung (Translation) der Genom-RNA entsteht eine Virus-RNA-Polymerase. Diese wiederum produziert eine negativsträngiges Vorlage (Template), aus der eine Reihe von subgenomischer RNAs (sgRNAs) generiert werden, die schließlich in die viralen Proteine übersetzt werden:[3]
Die Virus-Replikation erfolgt im Zytoplasma der Wirtszellen. Sie folgt dem Modell (Standard) der Replikation von (+)ssRNA-Viren (Einzelstrang-RNA-Viren positiver Polarität). Die Transkription erfolgt dem Muster für (+)ssRNA-Viren. Die Translation erfolgt durch Leaky Scanning. Die Übertragungswege sind per Vektor und mechanisch.[2]
Alle bekannten Wirte infizieren verschiedene Blütenpflanzen (Magnoliopsida).
Vertreter der Gattung Potexvirus sind weltweit verbreitet.
Das International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) hat mit Stand April 2020 in der Gattung Potexvirus folgende Arten (Spezies) bestätigt:
Weitere vorgeschlagene Mitglieder sind:
Potexvirus ist eine Gattung von Viren in der Ordnung Tymovirales, in der Familie Alphaflexiviridae. Als natürliche Wirte dienen Pflanzen.
Anfang April 2021 gab es 38 Spezies (Arten) in dieser Gattung, einschließlich der Typusart Kartoffelvirus X (engl. Potato virus X). Zu den Krankheiten, die mit dieser Gattung assoziiert werden, gehören Mosaik- und Ringspot-Symptome.
Der Gattungsname leitet sich ab von der englischen Bezeichnung der Typusart Potato Virus X und der Endung -virus für Virusgattungen.
Potexvirus is a genus of pathogenic viruses in the order Tymovirales, in the family Alphaflexiviridae. Plants serve as natural hosts. There are 48 species in this genus, three of which are assigned to a subgenus. Diseases associated with this genus include: mosaic and ringspot symptoms.[1][2] The genus name comes from POTato virus X).
Potexvirus contains one subgenus that has three species and 45 additional species unassigned to a subgenus. The following 48 species are assigned to the genus:[2]
The following species are unassigned to a subgenus:
The virion length may vary considerably (between 470-1000 nanometers or more) and is 12-13 nm in diameter. The pitch of the helix is of the basic helix 3.3-3.7 nm (8-9 copies of the coat protein per turn). It is non-enveloped, flexuous and filamentous. The coat itself is composed of 1000-1500 copies of the coat protein.[1]
The genome is linear, 5.9-7 kilobases in length with a capped 5' end and a polyadenylated 3' end. The genome encodes 5 proteins. From left to right these proteins are: the viral replication protein that consists of a capping enzyme domain, a helicase-like domain, the RNA dependent RNA polymerase, three proteins - the triple gene block (TGB) 1, 2 and 3 - and the coat protein.[1]
The RNA is translated giving rise to the viral RNA polymerase. This in turn produces a negative stranded template from which a series of subgenomic RNAs are generated. These subgenomic RNAs are then translated into the viral proteins.
The 5' end is about 80 nucleotides in length and typically begins with the sequence GAAAA.[3]
In addition to its RNA polymerase activity, the viral RNA polymerase (molecular weight ~150 kiloDaltons) also has methyltransferase and RNA helicase activities.
The TGB proteins are conserved among the Allexivirus, Carlavirus, Foveavirus, Furovirus, Hordeivirus, Pecluvirus, Pomovirus and Potexvirus genera. Their functions are a matter of active research.
TGB 1 (molecular weight 23 kDa) is a multifunctional protein. It has RNA helicase activity and seems to be involved in cell to cell movement.
The TGB 2 (molecular weight 11 kDa) and TGB 3 (molecular weight 10 kDa) proteins associate with the endoplasmic reticulum.
The coat protein has a molecular weight of ~25kDa.
The 3' untranslated region is ~100 nucleotides in length.
Viral replication is cytoplasmic. Entry into the host cell is achieved by penetration into the host cell. Replication follows the positive stranded RNA virus replication model. Positive stranded RNA virus transcription is the method of transcription. Translation takes place by leaky scanning. The virus exits the host cell by tripartite non-tubule guided viral movement. The virus is transmitted via a vector (insects). Transmission routes are vector and mechanical.[1]
Known hosts are various flowering plants.
These viruses appear to occur worldwide.
Potexvirus is a genus of pathogenic viruses in the order Tymovirales, in the family Alphaflexiviridae. Plants serve as natural hosts. There are 48 species in this genus, three of which are assigned to a subgenus. Diseases associated with this genus include: mosaic and ringspot symptoms. The genus name comes from POTato virus X).
Potexvirus[1] est un genre de virus de la famille des Alphaflexiviridae, qui comprend 38 espèces officiellement décrites, dont le PVX (Potato virus X), le virus X de la pomme de terre, qui est l'espèce-type, et 18 espèces proposées. Ce sont des virus à ARN simple brin à polarité positive, rattachés au groupe IV de la classification Baltimore, qui infectent des plantes herbacées (phytovirus).
Ces virus n'ont pas de vecteurs biologiques connus et la transmission se fait par inoculation mécanique. Les symptômes se manifestent sous forme de mosaïques ou d'anneaux nécrotiques. Les virions, en forme de bâtonnets filamenteux et flexueux, sont relativement courts, d'une longueur d'environ 470 à 580 nm.
Selon NCBI (22 janvier 2021)[2] :
Potexvirus est un genre de virus de la famille des Alphaflexiviridae, qui comprend 38 espèces officiellement décrites, dont le PVX (Potato virus X), le virus X de la pomme de terre, qui est l'espèce-type, et 18 espèces proposées. Ce sont des virus à ARN simple brin à polarité positive, rattachés au groupe IV de la classification Baltimore, qui infectent des plantes herbacées (phytovirus).
Ces virus n'ont pas de vecteurs biologiques connus et la transmission se fait par inoculation mécanique. Les symptômes se manifestent sous forme de mosaïques ou d'anneaux nécrotiques. Les virions, en forme de bâtonnets filamenteux et flexueux, sont relativement courts, d'une longueur d'environ 470 à 580 nm.
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