Cystoviridae és una família de virus d'ARN bicatenari que infecten certs bacteris gramnegatius.
Tots els cystovirus tenen en total 14 kb de longitud i una capa externa de lípids i proteïnes. Molts cystovirus infecten espècies de Pseudomonas.[1] L’espècie tipus és Pseudomonas phage Φ6, però n’hi ha altres com Φ7, Φ8, Φ9, Φ10, Φ11, Φ12 i Φ13 identificats,[2] també s'han aïllat altres cystovirus.[1]
Cystoviridae és una família de virus d'ARN bicatenari que infecten certs bacteris gramnegatius.
Tots els cystovirus tenen en total 14 kb de longitud i una capa externa de lípids i proteïnes. Molts cystovirus infecten espècies de Pseudomonas. L’espècie tipus és Pseudomonas phage Φ6, però n’hi ha altres com Φ7, Φ8, Φ9, Φ10, Φ11, Φ12 i Φ13 identificats, també s'han aïllat altres cystovirus.
Die Cystoviridae sind eine Virusfamilie behüllter RNA-Viren mit segmentiertem doppelsträngigem Genom. Die Familie umfasst bislang (Stand Januar 2021) nur eine einzige offiziell bestätigte Gattung Cystovirus. Als Bakteriophage nutzt es verschiedene Gram-negative Bakterien als Wirt.
Cystoviren sind die einzige Bakteriophagenfamilie mit einer vollständigen Virushülle und die einzige mit RNA-basiertem Genom. Die Familien der Tectiviridae und der Corticoviridae haben zwar Lipide in ihren Kapsiden eingeschlossen, aber keine äußere Virushülle.
Die Familie der Cystoviren scheint am nächsten mit den Reoviridae verwandt zu sein,[3] besitzen jedoch auch Homologien zu den Totiviridae. Dadurch sind Cystoviren die einzige Familie von Bakteriophagen, die näher mit Viren von Eukaryoten verwandt sind, als mit anderen Phagen.
Das Genom der Cystoviren besteht aus drei Segmenten (tripartit): Das S-Segment mit 2,9 kbp (Kilobasenpaaren), das M-Segment mit 4 kbp und L-Segment mit 6,4 kbp. Das Genom kodiert für 12 Proteine. Die meisten identifizierten Cystoviren infizieren Arten der Gattung Pseudomonas, wobei dies auch an der Untersuchungs- und Anreicherungsmethode liegen kann.[4] Die Pseudomonas-Phagen Phi6, Phi7, Phi8, Phi9, Phi10, Phi11, Phi12 und Phi13 wurden charakterisiert und benannt,[5] weitere wurden bisher nur isoliert.[4]
Während der Tropismus bei manchen Cystoviren wie Phi6 über die Bindung des multimeren Proteins P3 an Typ-IV-Pili als Rezeptor bestimmt wird, verwenden Phi8, Phi12 und Phi13 ein heterodimeres Protein, welches an Lipopolysaccharide bindet.
Das Protein P6 vermittelt die Fusion mit der Zellmembran der Wirtszelle und das anschließende Einschleusen des Nukleokapsids, ohne die RNA zu entpacken. P5 ist ein hydrolytisches Enzym zur Auflösung der bakteriellen Proteoglykan-Schicht. P2 sorgt als RNA-abhängige RNA-Polymerase für die Replikation des Genoms innerhalb des Nukleokapsids. P4 befördert die einzelsträngigen viralen RNA-Segmente positiver Polarität unter ATP-Verbrauch in die neu hergestellten Kapsidproteine, wo sie durch P2 zur doppelsträngigen RNA vervollständigt werden. Die Zelle wird anschließend durch Lyse verlassen.
Das ICTV hat mit der Master Species List #35 vom März 2020 die Cystoviridae dem neu geschaffenen Phylum Duplornaviricota [en] zugeordnet.[6] Eine Kladogramm findet sich bei Picornavirales §ICTV Master Species List #35. Vom ICTV offiziell bestätigt ist in dieser Familie lediglich die einzige Gattung Cystovirus (ist also monotypisch). Nach diesem Stand besteht die Familie aus folgenden Mitgliedern (ergänzt um Vorschläge nach NCBI mit Stand 6. Februar 2021[7] und nach Mindich 1999 – in Anführungszeichen):
Die Cystoviridae sind eine Virusfamilie behüllter RNA-Viren mit segmentiertem doppelsträngigem Genom. Die Familie umfasst bislang (Stand Januar 2021) nur eine einzige offiziell bestätigte Gattung Cystovirus. Als Bakteriophage nutzt es verschiedene Gram-negative Bakterien als Wirt.
Cystoviren sind die einzige Bakteriophagenfamilie mit einer vollständigen Virushülle und die einzige mit RNA-basiertem Genom. Die Familien der Tectiviridae und der Corticoviridae haben zwar Lipide in ihren Kapsiden eingeschlossen, aber keine äußere Virushülle.
Die Familie der Cystoviren scheint am nächsten mit den Reoviridae verwandt zu sein, besitzen jedoch auch Homologien zu den Totiviridae. Dadurch sind Cystoviren die einzige Familie von Bakteriophagen, die näher mit Viren von Eukaryoten verwandt sind, als mit anderen Phagen.
Cystovirus is a genus of double-stranded RNA viruses which infects bacteria. It is the only genus in the family Cystoviridae. The name of the group cysto derives from Greek kystis which means bladder or sack. There are seven species in this genus.[1][2][3]
Pseudomonas virus phi6 was the first virus in this family to be discovered and was initially characterized in 1973 by Anne Vidaver at the University of Nebraska. She found that when she cultured the bacterial strain Pseudomonas phaseolicola HB1OY with halo blight infected bean straw, cytopathic effects were detected in cultured lawns, indicating that there was a lytic microbe or bacteriophage present.[4]
In 1999, phi7–14 were identified by the laboratory of Leonard Mindich at the Public Health Research Institute associated with New York University. They did this by culturing various leaves in Lysogeny Broth and then plating the broth on lawns of Pseudomonas syringae pv phaseolicola. They were able to identify viral plaques from this and then subsequently sequence their genomes.[5]
Cystovirus particles are enveloped, with icosahedral and spherical geometries, and T=13, T=2 symmetry. The virion diameter is around 85 nm. Cystoviruses are distinguished by their outer layer protein and lipid envelope. No other bacteriophage has any lipid in its outer coat, though the Tectiviridae and the Corticoviridae have lipids within their capsids.[1][2]
Cystoviruses have a tripartite double-stranded RNA genome which is approximately 14 kbp in total length. The genome is linear and segmented, and labeled as large (L) 6.4 kbp, medium (M) 4 kbp, and small (S) 2.9 kb in length. The genome codes for twelve proteins.[1][2]
Cytoviruses enter the bacteria by adsorption on its pilus and then membrane fusion. Viral replication is cytoplasmic. Replication follows the double-stranded RNA virus replication model. Double-stranded RNA virus transcription is the method of transcription. The progeny viruses are released from the cell by lysis.[1][2]
Most identified cystoviruses infect Pseudomonas species, but this is likely biased due to the method of screening and enrichment.[6] There are many proposed members of this family. Pseudomonas viruses φ7, φ8, φ9, φ10, φ11, φ12, and φ13 have been identified and named,[5] but other cystovirus-like viruses have also been isolated.[6] These seven putative relatives are classified as either close (φ7, φ9, φ10, φ11) or distant (φ8, φ12, φ13) relatives to φ6,[5] with the distant relatives thought to infect via the LPS rather than the pili.[7]
However, cystoviruses do not only infect Pseudomonas. But also bacteria of the genera Streptomyces,[8] Microvirgula,[9] Acinetobacter,[10] Lactococcus, Pectobacterium,[11] and possibly other bacterial genera.
Members of the Cystoviridae appear to be most closely related to the Reoviridae,[12] but also share homology with the Totiviridae. In particular, the structural genes of cystoviruses are highly-similar to those used by a number of dsRNA viruses that infect eukaryotes.[13] The genus Cystovirus has seven species:[1]
Other unassigned phages:
Cystovirus is a genus of double-stranded RNA viruses which infects bacteria. It is the only genus in the family Cystoviridae. The name of the group cysto derives from Greek kystis which means bladder or sack. There are seven species in this genus.
Cystoviridae es una familia de virus que infectan bacterias (bacteriófagos). Presentan un genoma de ARN bicatenario por lo que se incluyen en el Grupo III de la Clasificación de Baltimore. La cápside está estructuralmente definida por una simetría compleja y poseen una envoltura viral.[1] El único género de la familia es Cystovirus.
Todos los cistovirus se caracterizan por sus tres cadenas (análogas a cromosomas) de ARN bicatenario, totalizando aproximadamente 14 kb, sus proteínas y una capa exterior lipídica. No se conocen otros bacteriófagos que tengan lípidos en su cubierta exterior, aunque Tectiviridae y Corticoviridae tienen lípidos dentro de su cápside. Se pueden dividir en dos grupos de virus. El primer grupo está formado por virus líticos que infectan bacterias gram-negativas siendo este grupo el mejor estudiado.[2][3] Un segundo grupo está formado por virus atemperados que infectan bacterias gram-positivas.[4] Muchos han sido aislados, principalmente por metagenómica.[5][4]
Cystoviridae esta íntimamente relacionado con Reoviridae,[6] y Totiviridae, por ello estos son reunidos en el filo Duplornaviricota los cuales parecen ser ancestros de los virus ARN monocatenario negativo (Negarnaviricota).
Datos: Q1149066
Multimedia:
Especies: Cystoviridae
Cystoviridae es una familia de virus que infectan bacterias (bacteriófagos). Presentan un genoma de ARN bicatenario por lo que se incluyen en el Grupo III de la Clasificación de Baltimore. La cápside está estructuralmente definida por una simetría compleja y poseen una envoltura viral. El único género de la familia es Cystovirus.
Todos los cistovirus se caracterizan por sus tres cadenas (análogas a cromosomas) de ARN bicatenario, totalizando aproximadamente 14 kb, sus proteínas y una capa exterior lipídica. No se conocen otros bacteriófagos que tengan lípidos en su cubierta exterior, aunque Tectiviridae y Corticoviridae tienen lípidos dentro de su cápside. Se pueden dividir en dos grupos de virus. El primer grupo está formado por virus líticos que infectan bacterias gram-negativas siendo este grupo el mejor estudiado. Un segundo grupo está formado por virus atemperados que infectan bacterias gram-positivas. Muchos han sido aislados, principalmente por metagenómica.
Cystoviridae esta íntimamente relacionado con Reoviridae, y Totiviridae, por ello estos son reunidos en el filo Duplornaviricota los cuales parecen ser ancestros de los virus ARN monocatenario negativo (Negarnaviricota).
Cystoviridae è una famiglia di virus che infettano i batteri (batteriofagi). Hanno un genoma di RNA a doppio filamento e sono quindi inclusi nel gruppo III della classificazione di Baltimore. Il capside è strutturalmente definito dalla simmetria complessa e ha un involucro virale. L'unico genere della famiglia è Cystovirus.
Tutti i cistovirus sono caratterizzati dai loro tre filamenti (analoghi ai cromosomi) di RNA a doppia elica, per un totale di circa 14 kb, dalle loro proteine e da uno strato lipidico esterno. Nessun altro batteriofago è noto per avere lipidi nel loro guscio esterno, sebbene Tectiviridae e Corticoviridae abbiano lipidi all'interno del loro capside. La specie tipo è lo fago Φ6 di Pseudomonas, ma sono noti molti altri membri di questa famiglia, di cui hanno nomi Φ7, Φ8, Φ9, Φ10, Φ11, Φ12 e Φ13,3 e molti altri sono stati isolati.
Cystoviridae è strettamente imparentato con Reoviridae, e Totiviridae, per questo motivo sono raccolti nel Duplornaviricota phylum che sembrano essere gli antenati dei virus a RNA a filamento singolo negativo (Negarnaviricota). Cystoviridae sembra essere l'antenato dei virus Duplornaviricota phylum. I cistovirus ei loro parenti sono probabilmente discendenti di repliconi primordiali del mondo a RNA.
Cystoviridae è una famiglia di virus che infettano i batteri (batteriofagi). Hanno un genoma di RNA a doppio filamento e sono quindi inclusi nel gruppo III della classificazione di Baltimore. Il capside è strutturalmente definito dalla simmetria complessa e ha un involucro virale. L'unico genere della famiglia è Cystovirus.
Tutti i cistovirus sono caratterizzati dai loro tre filamenti (analoghi ai cromosomi) di RNA a doppia elica, per un totale di circa 14 kb, dalle loro proteine e da uno strato lipidico esterno. Nessun altro batteriofago è noto per avere lipidi nel loro guscio esterno, sebbene Tectiviridae e Corticoviridae abbiano lipidi all'interno del loro capside. La specie tipo è lo fago Φ6 di Pseudomonas, ma sono noti molti altri membri di questa famiglia, di cui hanno nomi Φ7, Φ8, Φ9, Φ10, Φ11, Φ12 e Φ13,3 e molti altri sono stati isolati.
Cystoviridae è strettamente imparentato con Reoviridae, e Totiviridae, per questo motivo sono raccolti nel Duplornaviricota phylum che sembrano essere gli antenati dei virus a RNA a filamento singolo negativo (Negarnaviricota). Cystoviridae sembra essere l'antenato dei virus Duplornaviricota phylum. I cistovirus ei loro parenti sono probabilmente discendenti di repliconi primordiali del mondo a RNA.
囊狀噬菌體科Cystoviridae
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