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Pseudoalteromonas Bacteriophage Pm2

Corticoviridae

Corticoviridae ( Catalan; Valencian )

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Corticoviridae és una família de fags (virus que infecten bacteris) que pertany al grup I de la classificació de Baltimore. Consisteixen en una càpsida icosaèdrica de 60 nm de diàmetre i una membrana interna lipídica a més d'un escut de proteïna.[1]

El primer virus descobert d'aquesta espècie rep el nom de PM2 i va ser isolat a Xile en una badia contaminada. El PM2 és el primer bacteriòfag en el qual s'ha demostrat la presència de lípids en el virió.[2]

El genoma no està segmentat, constitueix el 13% del pes del virus té un ADN bicatenari, conté una sola molècula d'ADN circular, superenrotllada, de 9500-12000 nucleòtids de longitud i amb un contingut de GC del 43% En laboratori les seves propietats especials fan que s'usi en assaigs enzimàtics.

Referències

  1. Kiveld, H.M., Kalkkinen, N. and Bamford, D.H. (2002). Bacteriophage PM2 has a protein capsid surrounding a spherical lipid-protein core. J. Virol., 76, 8169-8178.
  2. Calendar, Richard. The bacteriophages. Oxford University Press US, 2006, p. 171. ISBN 9780195148503.

Enllaços externs

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Corticoviridae: Brief Summary ( Catalan; Valencian )

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Corticoviridae és una família de fags (virus que infecten bacteris) que pertany al grup I de la classificació de Baltimore. Consisteixen en una càpsida icosaèdrica de 60 nm de diàmetre i una membrana interna lipídica a més d'un escut de proteïna.

El primer virus descobert d'aquesta espècie rep el nom de PM2 i va ser isolat a Xile en una badia contaminada. El PM2 és el primer bacteriòfag en el qual s'ha demostrat la presència de lípids en el virió.

El genoma no està segmentat, constitueix el 13% del pes del virus té un ADN bicatenari, conté una sola molècula d'ADN circular, superenrotllada, de 9500-12000 nucleòtids de longitud i amb un contingut de GC del 43% En laboratori les seves propietats especials fan que s'usi en assaigs enzimàtics.

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Corticoviridae ( German )

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Die Virusfamilie Corticoviridae (lateinisch cortex ‚Rinde, Kruste‘) umfasst nur eine monotypische Gattung Corticovirus von Bakteriophagen. Die einzige bislang (Stand März 2019) vom International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) bestätigte Spezies Pseudoalteromonas virus PM2 (auch Pseudoalteromonas Phage PM2, PM2-Phage, Alteromonas Phage PM2 genannt) hat ein zirkuläres, doppelsträngiges DNA-Genom und ein ca. 56 nm im Durchmesser großes, unbehülltes ikosaedrischen Kapsid.

Aufbau

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Rekonstruktion eines Kapsids von Pseudoalteromonas phage PM2
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Eintrittsmechanismus von Pseudoalteromonas phage PM2

Die Kapsomere sind aus Trimeren des Kapsidproteins P2 aufgebaut; an den Ecken der Ikosaeder-Struktur befinden sich Fortsätze (spikes), die durch das Virusprotein P1 gebildet werden. Innerhalb (!) des Kapsids befindet sich ein Lipidmembran-Bläschen, das aus Virusproteinen und der Lipidmembran des Wirtsbakteriums besteht. Dieses innere Membranbläschen hat der PM2-Phage mit den Tectiviridae gemein, es dient jedoch dem PM2-Phagen nicht zur Injektion der DNA in das Wirtsbakterium.

Genom

Das ringförmige Genom ist in stark verdrillter Form (supercoiled) innerhalb des Membranbläschens verpackt. Die doppelsträngige DNA ist 10.079 bp (Basenpaare) groß und codiert für neun Strukturproteine (P1-P9), fünf Nicht-Strukturproteine (P12-16) und sieben Genprodukte unbekannter Funktion.

Wirte

Bisher sind zwei marine Bakterienspezies, Pseudoalteromonas BAL-31 und ER72M2, als Wirte für den PM2-Phagen identifiziert.

Systematik

Das National Center for Biotechnology Information (NCBI) nennt neben der ICTV-bestätigten Spezies weitere Kandidaten:

  • Gattung Corticovirus
  • Spezies Pseudoalteromonas virus Cr39582 (Pseudoalteromonas phage Cr39582)
  • Spezies Pseudoalteromonas virus PM2 (Typus)
  • Spezies Pseudoalteromonas phage GXT1010 (vorgeschlagen)[2]

Literatur

  • R.T. Espejo, E.S. Canelo: Properties of bacteriophage PM2: A lipid-containing bacterial virus. Virology (1968) 34, S. 738–747
  • H.M. Kivelä, N. Kalkkinnen, D.H. Bamford: Bacteriophage PM2 has a protein capsid surrounding a spherical lipid-protein core. Journal of Virology (2002) 76, S. 8169–8178
  • C.M. Fauquet, M.A. Mayo et al.: Eighth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses, London, San Diego, 2004
  • David M. Knipe, Peter M. Howley et al. (Hrsg.): Fields’ Virology, 4. Auflage, Philadelphia 2001

Einzelnachweise

  1. a b c d e ICTV: ICTV Taxonomy history: Pseudoalteromonas virus Cr39582, EC 51, Berlin, Germany, July 2019; Email ratification March 2020 (MSL #35)
  2. NCBI: Pseudoalteromonas phage GXT1010 (species)
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Corticoviridae: Brief Summary ( German )

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Die Virusfamilie Corticoviridae (lateinisch cortex ‚Rinde, Kruste‘) umfasst nur eine monotypische Gattung Corticovirus von Bakteriophagen. Die einzige bislang (Stand März 2019) vom International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) bestätigte Spezies Pseudoalteromonas virus PM2 (auch Pseudoalteromonas Phage PM2, PM2-Phage, Alteromonas Phage PM2 genannt) hat ein zirkuläres, doppelsträngiges DNA-Genom und ein ca. 56 nm im Durchmesser großes, unbehülltes ikosaedrischen Kapsid.

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Corticovirus

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Corticovirus is a genus of viruses in the family Corticoviridae.[2] Corticoviruses are bacteriophages; that is, their natural hosts are bacteria. The genus contains two species.[2][3] The name is derived from Latin cortex, corticis (meaning 'crust' or 'bark'). However, prophages closely related to PM2 are abundant in the genomes of aquatic bacteria, suggesting that the ecological importance of corticoviruses might be underestimated.[4] Bacteriophage PM2 was first described in 1968 after isolation from seawater sampled from the coast of Chile.[5]

Taxonomy

The genus contains the following species:[6]

Other unassigned phages:[7]

Virology

The virons consist of a round, icosahedral, non-enveloped capsid of a diameter of 60 nm and an internal lipid membrane located between outer and inner protein shell.[8] The shells are composed of three layers whose surfaces reveals a pattern with distinctive features,[9] including bush-like spikes protruding from the twelve vertices.[10]

The icosahedral capsid (T = 21) is 56 nanometers (nm) in diameter and is composed of 1200 P1 (spike) and 60 P2 (capsid) proteins. The pentameric receptor-binding spikes protrude from the 12 fivefold axes. The capsid encloses an internal lipid core containing the structural proteins P3 to P10.

Genome

The genome is not segmented, constitutes 13% of the virus's weight and contains a single molecule of circular, supercoiled, double-stranded DNA of 10 kilobases in length. The genome has a g + c content of 43%.[11] It encodes ~21 proteins.

Transcription is organised into three operons.

Replication of the genome is via a rolling-circle mechanism, initiated by the virus encoded endonuclease P12.

Life cycle

Entry mechanism of Pseudoalteromonas phage PM2

Viral replication is cytoplasmic. Entry into the host cell is achieved by adsorption to the host cell surface followed by fusion of the viral membrane with the outer membrane of the host cell and subsequent genome delivery into the cell interior.[12] DNA-templated transcription is the method of transcription. Bacteria of the genera Pseudoalteromonas, Marinomonas and Vibrio serve as the natural host. Corticovirus PM2 is a lytic virus and at the end of the infection cycle disrupts the host cell using a unique lysis system consisting of phage-encoded proteins P17 and P18 as well as an unidentified host autolysin.[13] However, identification of PM2-like proviruses in bacterial genomes indicates that other members of this family might be temperate viruses. Transmission routes are passive diffusion.[3]

References

  1. ^ Abrescia, Nicola G.A.; Grimes, Jonathan M.; Kivelä, Hanna M.; Assenberg, Rene; Sutton, Geoff C.; Butcher, Sarah J.; Bamford, Jaana K.H.; Bamford, Dennis H.; Stuart, David I. (September 2008). "Insights into Virus Evolution and Membrane Biogenesis from the Structure of the Marine Lipid-Containing Bacteriophage PM2". Molecular Cell. 31 (5): 749–761. doi:10.1016/j.molcel.2008.06.026. PMID 18775333.
  2. ^ a b "Corticoviridae". ICTV Online (10th) Report.
  3. ^ a b "Viral Zone". ExPASy. Retrieved 15 June 2015.
  4. ^ Krupovic M, Bamford DH (2007). "Putative prophages related to lytic tailless marine dsDNA phage PM2 are widespread in the genomes of aquatic bacteria". BMC Genomics. 8: 236. doi:10.1186/1471-2164-8-236. PMC 1950889. PMID 17634101.
  5. ^ Espejo, Romilio T.; Canelo, Eliana S. (April 1968). "Properties of bacteriophage PM2: A lipid-containing bacterial virus". Virology. 34 (4): 738–747. doi:10.1016/0042-6822(68)90094-9.
  6. ^ "Virus Taxonomy: 2020 Release". International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV). March 2021. Retrieved 22 May 2021.
  7. ^ Corticoviridae. NCBI Taxonomy.
  8. ^ Kiveld, H.M., Kalkkinen, N. and Bamford, D.H. (2002). Bacteriophage PM2 has a protein capsid surrounding a spherical lipid-protein core" J. Virol. 76, 8169-8178.
  9. ^ Kiveld, H.M., Männistö, R.H., Kalkkinen, N. and Bamford, D.H. (1999). Purification and protein composition of PM2, the first lipid-containing bacterial virus to be isolated" Virology 262, 364-374.
  10. ^ Harrison, S.C., Caspar, D.L., Camerini-Otero, R.D. and Franklin, R.M. (1971). Lipid and protein arrangement in bacteriophage PM2. Nat. New Biol., 229, 197-201.
  11. ^ Männistö, R.H., Kivelä, H.M., Paulin, L., Bamford, D.H. and Bamford, J.K.H. (1999). The complete genome sequence of PM2, the first lipid-containing bacterial virus to be isolated" Virology 262, 355-363.
  12. ^ Cvirkaite-Krupovic V, Krupovic M, Daugelavicius R, Bamford DH (2010). "Calcium ion-dependent entry of the membrane-containing bacteriophage PM2 into its Pseudoalteromonas host". Virology. 405 (1): 120–128. doi:10.1016/j.virol.2010.05.021. PMID 20646729.
  13. ^ Krupovic M, Daugelavicius R, Bamford DH (2007). "A novel lysis system in PM2, a lipid-containing marine double-stranded DNA bacteriophage". Mol Microbiol. 64 (6): 1635–48. doi:10.1111/j.1365-2958.2007.05769.x. PMID 17555443.

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Corticovirus: Brief Summary

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Corticovirus is a genus of viruses in the family Corticoviridae. Corticoviruses are bacteriophages; that is, their natural hosts are bacteria. The genus contains two species. The name is derived from Latin cortex, corticis (meaning 'crust' or 'bark'). However, prophages closely related to PM2 are abundant in the genomes of aquatic bacteria, suggesting that the ecological importance of corticoviruses might be underestimated. Bacteriophage PM2 was first described in 1968 after isolation from seawater sampled from the coast of Chile.

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Corticoviridae ( Spanish; Castilian )

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Corticoviridae es una familia que infectan bacterias acuáticas (bacteriófagos).[1]​ Los virus son icosaédricos, con membrana interna, que contienen un genoma con ADN circular de cadena doble, por lo que pertenecen al Grupo I de la Clasificación de Baltimore. El genoma no es segmentado, constituye el 13% del peso del virus y contiene una sola molécula de ADN circular, superenrollada, de 9500-12000 nucleótidos de longitud y con un contenido GC del 43%. La especie tipo es el fago PM2 de Pseudoalteromonas.[2]

Albergan dicha información genética en una cápside carente de envoltura viral y estructuralmente definida por una simetría compleja, con aspecto esférico o subesférico y rica en lípidos.[3]​ La cápside icosaedra tiene un diámetro de 60 nm y presenta una membrana lipídica interna situada entre las cubiertas de proteínas exterior e interior.[4]​ Las cubiertas se componen de tres capas, con superficies que revelan un patrón con características distintivas,[5]​ incluyendo protuberancias de tipo espiga en los doce vértices.[6]

Referencias

  1. Krupovic M, Bamford DH (2007). «Putative prophages related to lytic tailless marine dsDNA phage PM2 are widespread in the genomes of aquatic bacteria». BMC Genomics 8: 236. PMC 1950889. PMID 17634101. doi:10.1186/1471-2164-8-236.
  2. Oksanen, Hanna M. (mayo de 2017). «ICTV Virus Taxonomy Profile: Corticoviridae» [Perfil taxonómico de virus del ICTV: Corticoviridae]. J Gen Virol (en inglés) (Microbiology Society) 98 (5): 888-889. PMID 28581380. doi:10.1099/jgv.0.000795. Consultado el 25 de marzo de 2020.
  3. Prescott, L.M. (199). Microbiología. McGraw-Hill Interamericana de España, S.A.U. ISBN 84-486-0261-7.
  4. Kiveld, H.M., Kalkkinen, N. and Bamford, D.H. (2002). Bacteriophage PM2 has a protein capsid surrounding a spherical lipid-protein core. J. Virol., 76, 8169-8178.
  5. Kiveld, H.M., Männistö, R.H., Kalkkinen, N. and Bamford, D.H. (1999). Purification and protein composition of PM2, the first lipid-containing bacterial virus to be isolated. Virology, 262, 364-374.
  6. Harrison, S.C., Caspar, D.L., Camerini-Otero, R.D. and Franklin, R.M. (1971). Lipid and protein arrangement in bacteriophage PM2. Nat. New Biol., 229, 197-201.
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Corticoviridae: Brief Summary ( Spanish; Castilian )

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Corticoviridae es una familia que infectan bacterias acuáticas (bacteriófagos).​ Los virus son icosaédricos, con membrana interna, que contienen un genoma con ADN circular de cadena doble, por lo que pertenecen al Grupo I de la Clasificación de Baltimore. El genoma no es segmentado, constituye el 13% del peso del virus y contiene una sola molécula de ADN circular, superenrollada, de 9500-12000 nucleótidos de longitud y con un contenido GC del 43%. La especie tipo es el fago PM2 de Pseudoalteromonas.​

Albergan dicha información genética en una cápside carente de envoltura viral y estructuralmente definida por una simetría compleja, con aspecto esférico o subesférico y rica en lípidos.​ La cápside icosaedra tiene un diámetro de 60 nm y presenta una membrana lipídica interna situada entre las cubiertas de proteínas exterior e interior.​ Las cubiertas se componen de tres capas, con superficies que revelan un patrón con características distintivas,​ incluyendo protuberancias de tipo espiga en los doce vértices.​

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覆蓋噬菌體科 ( Chinese )

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覆蓋噬菌體科 病毒分类 族: 族 I (dsDNA) 分類

覆蓋噬菌體屬(Corticovirus)代表種:

  • 假交替單胞菌屬PM2噬菌體(Pseudoalteromonas phage PM2)
  • 交替單胞菌屬PM2(噬菌體Alteromonas phage PM2)
Marburg virus.jpg 這是與病毒相關的小作品。你可以通过编辑或修订扩充其内容。
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覆蓋噬菌體科: Brief Summary ( Chinese )

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覆蓋噬菌體科(Corticoviridae),Cortico-源自拉丁文,有厚皮之意。主要的宿主為細菌。

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