林鼠亚科（学名：Neotominae）是啮齿目仓鼠科的一个亚科，分布于美洲，种类很多：
侏鼠族（Baiomyini） 侏鼠属（Baiomys） 褐鼷鼠属（Scotinomys） 林鼠族（Neotomini） 林鼠属（Neotoma） 白眉林鼠属（Xenomys） 艾氏林鼠属（Hodomys） 纳氏林鼠属（Nelsonia） 赭鼠族（Ochrotomyini） 赭鼠属（Ochrotomys） 美洲禾鼠族（Reithrodontomyini） 白足鼠属（Peromyscus） 美洲禾鼠属（Reithrodontomys） 沙居食蝗鼠属（Onychomys） 火山鼠属（Neotomodon） 佛罗里达白足鼠属（Podomys） 巴拿马鹿鼠属（Isthmomys） 墨西哥巨齿鼠属（Megadontomys） 鹿鼠属（Habromys） 奥氏鼠属（Osgoodomys）
