Die Nocardiaceae bilden eine Familie innerhalb der Actinobakterien, die unter anderem die Gattungen Nocardia, Rhodococcus und Smaragdicoccus enthält. Alle Vertreter von der ehemals in Nocardiaceae stehenden, nun aufgelösten Gattung Micropolyspora findet man nun in der Gattung Nocardia.
Die Bakterien treten oft im Boden auf, einige Rhodococcus-Arten findet man auch in Darm von einigen Insekten. Die Gattung Smaragdicoccus mit der einzigen Art Smaragdicoccus niigatensis Adachi et al. wurde im Februar 2007 entdeckt und den Nocardiaceae zugeordnet.[1]
Die Bakteriengattungen Nocardia und Rhodococcus benötigen Sauerstoff. Geringe Mengen oder völligen Ausschluss von Sauerstoff können sie nicht tolerieren, weshalb sie als obligat aerob bezeichnet werden. Alle Arten sind unbeweglich. Auf den Katalase-Test reagieren sie positiv, sie produzieren das Enzym Katalase. Da sie nicht zur Photosynthese befähigt sind, erfolgt ihre Ernährung chemoorganotroph durch einen Atmungsstoffwechsel.
Meist bilden sie verzweigte Myzelfäden, die oft in älteren Kulturen unter Bildung von Kokken und stäbchenförmigen Zellen auseinanderbrechen. Teilweise entstehen Luftsporen.
Zu den Arten zählen wirtschaftlich relevante Arten sowie einige Krankheitserreger.
Die Nocardiaceae werden zusammen mit den Familien Corynebacteriaceae, Dietziaceae, Mycobacteriaceae, Segniliparaceae und Tsukamurellaceae zu der Unterordnung Corynebacterineae gestellt.[2] In anderen Quellen werden außerdem noch die Familien Williamsiaceae und Gordoniaceae geführt.[3] Seit 1999 wurden mehrere neue Bakterienarten entdeckt, die der neu beschriebenen Gattung Williamsia in der neuen Familie Williamsiaceae zugeordnet wurden. Nach der gültigen Systematik der Bakterien gehört diese Gattung jedoch zur Familie Nocardiaceae.[4] Die Familien Gordoniaceae und Nocardiaceae wurden 2009 zu der erweiterten Familie Nocardiaceae kombiniert.[4]
Nocardia ist die Typgattung der Familie Nocardiaceae. Zu den Nocardiaceae werden folgende Gattungen gestellt:[5]
Einige Arten von Nocardia mit der Typusart Nocardia asteroides (Eppinger 1891) Blanchard 1896:
Und eine Auswahl von Arten der Gattung Rhodococcus mit der Typusart Rhodococcus rhodochrous (Zopf 1891) Tsukamura 1974:
Die Arten von Micropolyspora Lechevalier et al. 1961 wurden in die Gattung Nocardia gestellt. Viele Arten von Rhodococcus wurden umgestellt, z. B. Rhodococcus aichiensis, Rhodococcus bronchialis, Rhodococcus chubuensis (nun Gordonia sputi), Rhodococcus rubropertinctus und andere in die Gattung Gordonia. Auch Vertreter von Nocardia wurden in andere Gattungen transferiert. So ist Nocardia sulphurea jetzt ein Synonym für Amycolatopsis sulphurea und Nocardia amarae für Gordonia amarae.[5]
Die Nocardiaceae bilden eine Familie innerhalb der Actinobakterien, die unter anderem die Gattungen Nocardia, Rhodococcus und Smaragdicoccus enthält. Alle Vertreter von der ehemals in Nocardiaceae stehenden, nun aufgelösten Gattung Micropolyspora findet man nun in der Gattung Nocardia.
Die Bakterien treten oft im Boden auf, einige Rhodococcus-Arten findet man auch in Darm von einigen Insekten. Die Gattung Smaragdicoccus mit der einzigen Art Smaragdicoccus niigatensis Adachi et al. wurde im Februar 2007 entdeckt und den Nocardiaceae zugeordnet.
The Nocardiaceae are a family of aerobic, non-fastidious, high G+C, Gram-positive actinomycetes that are commonly found in soil and water.[3] Members of this family have been isolated from Antarctic soils.[4] Nocardiaceae present coccobacilli, filamentous or, rarely, fragmented and palisading forms,[5] and filamentous species grow in a branching morphological pattern similar to fungal hyphae.[6]
The Nocardiaceae form a monophyletic clade within the Corynebacteriales in both 16S rRNA and protein-based phylogenetic trees.[7][8] A number of conserved signature indels and conserved signature proteins have been identified which are uniquely found in the genera Nocardia and Rhodococcus, supporting a close relationship between the two genera.[8] Recent proposals have been made, based on 16S rRNA signature nucleotides and chemotaxonomic markers, to add the genera Gordonia, Skermania, Williamsia, Millisia, and Smaragdicoccus to the family Nocardiaceae.[7][9] However, no conserved signature indels or proteins have been found that are commonly shared by Nocardia, Rhodococcus, and Gordonia, the fully sequenced members of the proposed Nocardiaceae revision.[8]
Some species colonize animals, and members of the Nocardia and Rhodococcus genera can cause infection in humans and livestock.[10] Nocardiosis represent also a serious health problem for fish (marine or not). [11] Many members of this family integrate mycolic acids into their cell wall, and as a result, Nocardia spp. may be mistaken for mycobacteria when viewed under a microscope following an acid-fast stain.[12]
Nocardia species are often responsible for the accumulation of foam that occurs in activated sludge during sewage treatment.[6][13][14][15] Biological foaming can be problematic for the water treatment process, and foam accumulation is reduced by adding surfactants to the wastewater.[16][17]
Soil Nocardiaceae can degrade hydrocarbons (e.g. petroleum distillates) and have been proposed as bioremediation agents for environmental spills.[18]
In the 1980s, all Nocardiaceae species assigned to the genus Micropolyspora were transferred to the genera Nocardia or Nonomuraea in family Streptosporangiaceae, or Saccharopolyspora in family Pseudonocardiaceae.[19] This effectively ended the official status of this genus, but the name persists in older research articles.
The Nocardiaceae are a family of aerobic, non-fastidious, high G+C, Gram-positive actinomycetes that are commonly found in soil and water. Members of this family have been isolated from Antarctic soils. Nocardiaceae present coccobacilli, filamentous or, rarely, fragmented and palisading forms, and filamentous species grow in a branching morphological pattern similar to fungal hyphae.
Les Nocardiaceae sont une famille de bactéries à Gram positif aérobies, non exigeantes, à G+C% élevé appartenant à l'ordre des Mycobacteriales dans la classe des Actinobacteria. Cette famille comprend plusieurs genres dont les Nocardia et les Rhodococcus sont les plus connus. Ce sont des bactéries que l'on trouve couramment dans l'eau, et le sol y compris en antarctique, et dont certaines sont aussi des pathogènes opportunistes pour l'homme, les animaux ou les plantes. Les nocardiaceae présentent des coccobacilles, des formes filamenteuses ou, rarement des formes fragmentées et palissadées. Les espèces filamenteuses se développent selon un schéma morphologique ramifié similaire aux hyphes fongiques.
Les Nocardiaceae sont une famille de bactéries à Gram positif aérobies, non exigeantes, à G+C% élevé appartenant à l'ordre des Mycobacteriales[2]. Ce sont des bactéries à Gram positif, que l'on trouve couramment dans le sol et l'eau et des membres de cette famille ont été isolés des sols antarctiques[3],[4]. Les nocardiaceae présentent des coccobacilles, des formes filamenteuses ou, rarement des formes fragmentées et palissadées[5]. Les espèces filamenteuses se développent selon un schéma morphologique ramifié similaire aux hyphes fongiques[6].
Certaines espèces de Nocardiaceae colonisent les animaux. Certaines espèces des genres Nocardia et Rhodococcus sont connues pour leurs capacités à provoquer des infections chez les humains et le bétail[7]. Les nocardioses représentent aussi un véritable problème pour les poissons marins et ceux d'eau douce[8].
De nombreux membres de cette famille intègrent des acides mycoliques dans leur paroi cellulaire et, par conséquent, les Nocardia spp. peuvent être confondues avec des mycobactéries lorsqu'ils sont observés au microscope après une coloration acido-résistante[9],[10].
Les espèces de Nocardia ou de Rhodococcus sont souvent responsables de l'accumulation de mousse qui se produit dans les boues activées lors du traitement des eaux usées[6],[11],[12],[13]. Le moussage biologique peut être problématique pour le processus de traitement de l'eau, et l'accumulation de mousse peut être réduite en ajoutant des agents tensioactifs aux eaux usées[14],[15].
Les Nocardiaceae présentes dans le sol peuvent dégrader les hydrocarbures. Elles ont d'ailleurs (par et ont été proposées comme agents de bioremédiation pour les déversements dans l'environnement des distillats de pétrole[16].
La famille des Nocardiaceae (Castellani and Chalmers 1919; emend. Rainey, Ward-Rainey, and Stackebrandt, 1997)[17] a été nommée d'après son genre type, les Nocardia(No.car.di.a’ce.ae. M.L. fem. n. Nocardia genre-type e la famille; -aceae, terminaison pour famille; M.L. fern. pl. n. Nocardiaceae, la famille Nocardiaceae). Cette famille contient le genre-typeNocardia ainsi que le genre Rhodococcus[17].
La taxonomie des Nocardiaceae a connu de nombreux remaniements. Dans les années 1980, toutes les espèces de Nocardiaceae attribuées au genre Micropolyspora ont été transférées aux genres Nocardia ou Nonomuraea dans la famille des Streptosporangiaceae, ou Saccharopolyspora et Saccharomonospora dans la famille des Pseudonocardiaceae[18]. Cela a effectivement mis fin au statut officiel de ce genre, mais le nom persiste dans des articles de recherche plus anciens.
En 1997, Stackebrandt et al. placent la famille des Nocardiaceae dans le sous-ordre Corynebacterineae, ordre des Actinomycetales[19].
Les Nocardiaceae ont récemment changé d'ordre passant des actinomycètes aux Mycobacteriales depuis l'amendement de Gupta en 2019 et validé par la LPSN la même année[20].
Les Nocardiaceae forment un clade monophylétique au sein des Corynebacteriales à la fois dans l'ARNr 16S et les arbres phylogénétiques à base de protéines[21],[20]. Un certain nombre de signatures d'indels conservés et de signatures de protéines conservées ont été identifiés qui se trouvent uniquement dans les genres Nocardia et Rhodococcus, soutenant une relation étroite entre les deux genres[20]. L'analyse des signatures d'ARNr 16S et des marqueurs chimiotaxonomiques, pour ajouter les genres Gordonia, Skermania, Williamsia, Millisia et Smaragdicoccus à la famille des Nocardiaceae a été proposée[21],[22]. Aucun indel ou signature de protéines conservées n'a été trouvée qui soit communément partagée par Nocardia, Rhodococcus et Gordonia, parmi les genres entièrement séquencés de la révision proposée des Nocardiaceae[20].
Les Nocardiaceae sont une famille de bactéries à Gram positif aérobies, non exigeantes, à G+C% élevé appartenant à l'ordre des Mycobacteriales dans la classe des Actinobacteria. Cette famille comprend plusieurs genres dont les Nocardia et les Rhodococcus sont les plus connus. Ce sont des bactéries que l'on trouve couramment dans l'eau, et le sol y compris en antarctique, et dont certaines sont aussi des pathogènes opportunistes pour l'homme, les animaux ou les plantes. Les nocardiaceae présentent des coccobacilles, des formes filamenteuses ou, rarement des formes fragmentées et palissadées. Les espèces filamenteuses se développent selon un schéma morphologique ramifié similaire aux hyphes fongiques.
As Nocardiáceas (Nocardiaceae) son unha familia de bacterias aerobias, grampositivas de elevado contido GC, da orde Actinomycetales, que se encontran comunmente no solo e na auga.[1] Illáronse membros desta familia nos solos antárticos.[2] As Nocardiaceae poden ser cocobacilos, bacterias filamentosas, ou, máis raramente, formas fragmentadas e palisadas, e as especies filamentosas crecen seguindo un patrón morfoloxicamente ramificado similar ás hifas dos fungos.[3]
As Nocardiaceae forman un clado monofilético dentro da súa orde tanto nas árbores filoxenéticas baseadas nos ARNr 16S coma en proteínas.[4][5] Identificáronse nelas varios indeis sinatura conservados e proteínas sinatura conservadas, que só se atopan nos xéneros Nocardia e Rhodococcus, o que apoia que existe unha estreita relación entre eses dous xéneros.[5] Fixéronse recentemente propostas baseadas en nucleótidos sinatura do ARNr 16S e marcadores quimiotaxonómicos, para engadir á familia Nocardiaceae os xéneros Gordonia, Skermania, Williamsia, Millisia, e Smaragdicoccus.[4][6] Porén, non se encontraron nestes xéneros indeis sinatura conservados nin proteínas comúns ás compartidas xeralmente por Nocardia, Rhodococcus e Gordonia, que son os membros co xenoma completamente secuenciado na revisión proposta das Nocardiaceae.[5]
Alogunhas especies colonizan os animais, e membros de Nocardia e Rhodococcus poden causar infeccións en humanos e gando.[7][8] Moitos membros desta familia teñen ácidos micólicos integrados na súa parede celular, e como resultado as Nocardia spp. poden ser confundidas con micobacterias cando se observan ao microscopio despois de facerlles a proba da resistencia a ácido-alcohol (acid-fastness).[9]
As especies de Nocardia son con frecuencia responsables da acumulación de escuma que se produce nos lodos activados durante o tratamento de augas residuais.[3][10][11][12] As escumas biolóxicas poden ser un problema para o proceso de tratamento de augas, e a súa acumulación redúcese ao engadir surfactantes ás augas residuais.[13][14]
As Nocardiaceae do solo poden degradar hidrocarburos (como os destilados do petróleo) e foron propostas como axentes de biorremediación para tratar vertidos no medioambiente.[15]
Na década de 1980, todas as especies de Nocardiaceae que estaban asignadas ao xénero Micropolyspora foron transferidas aos xéneros Nocardia, Nonomuraea da familia Streptosporangiaceae, ou ao Saccharopolyspora da familia Pseudonocardiaceae.[16] Isto supuxo a súa desaparición como xénero con status oficial actual, pero o nome segue aparecendo nos artigos de investigación anteriores a esa data.
As Nocardiáceas (Nocardiaceae) son unha familia de bacterias aerobias, grampositivas de elevado contido GC, da orde Actinomycetales, que se encontran comunmente no solo e na auga. Illáronse membros desta familia nos solos antárticos. As Nocardiaceae poden ser cocobacilos, bacterias filamentosas, ou, máis raramente, formas fragmentadas e palisadas, e as especies filamentosas crecen seguindo un patrón morfoloxicamente ramificado similar ás hifas dos fungos.
Nocardiaceae is een familie van aerobe bacteriën behorende tot de straalzwammen.
Nocardiaceae is een familie van aerobe bacteriën behorende tot de straalzwammen.
Nocardiaceae é uma família de bactérias aeróbicas, não-fastidiosas e gram-positivas encontradas no solo e na água.[1]
Na década de 80, todas as espécies de Nocardiaceae do gênero Micropolyspora foram transferidas para os gêneros Nocardia, Nonomuraea da família Streptosporangiaceae, e Saccharopolyspora da família Pseudonocardiaceae.[2]
Nocardiaceae é uma família de bactérias aeróbicas, não-fastidiosas e gram-positivas encontradas no solo e na água.
Nocardiaceae Castellani and Chalmers 1919 emend. Zhi et al. 2009
Nocardiaceae (лат.) — семейство бактерий порядка актиномицетов. Широко распространены в почве, некоторые виды рода Rhodococcus найдены в кишечнике некоторых насекомых. Аэробы, неподвижны. Представители рода нокардий (Nocardia) — возбудители нокардиоза.
После присоединения в 2009 году семейства Gordoniaceae, семейство Nocardiaceae на май 2015 г. состоит из 7—8 родов[1]:
Статус рода Micropolyspora неясен, типовой вид (Micropolyspora brevicatena) которого перенесён в род нокардий (Nocardia brevicatena (Lechevalier et al. 1961) Goodfellow and Pirouz 1982) вместе с частью видов, поэтому сам род стал младшим синонимом рода Nocardia. Один оставшийся вид (Micropolyspora internatus Agre et al. 1974) должен быть перенесён в другой род, но на июль 2017 г. этого не сделано[3].
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Nocardiaceae (лат.) — семейство бактерий порядка актиномицетов. Широко распространены в почве, некоторые виды рода Rhodococcus найдены в кишечнике некоторых насекомых. Аэробы, неподвижны. Представители рода нокардий (Nocardia) — возбудители нокардиоза.
Nocardia
Rhodococcus
Smaragdicoccus
ノカルディア科（Nocardiaceae）とは放線菌門放線菌綱における科の一つである。通性好気性、高GC含量、グラム陽性の真性細菌である[1]。一部の種は南極で発見されている[2]。ノカルディア科の細菌は球桿菌状、繊維状、あるいは稀に分解されて柵状の形態を示す[3]。繊維状の種は真菌の菌糸のように枝分かれながら成長する[4]。
ノカルディア科について、16S rRNAおよびタンパク質の配列解析に基づいた系統樹が両方とも作成されている[5][6]。ノカルディア科のconserved signature indelsとconserved signature proteinsの解析から、同科のNocardia属（ノカルディア属）とRhodococcus属（ロドコッカス属）は非常に近縁であることが明らかとなっている 。2012年現在、16S rRNAと化学分類学的マーカーの解析から、Gordonia属（ゴルドニア属）、Skermania属、Williamsia属、Millisia属、およびSmaragdicoccus属をノカルディア科に転籍させることが提案されている[7]。しかし、ノカルディア属、ロドコッカス属、ゴルドニア属の間で共有されているconserved signature indelsとconserved signature proteinsは発見されていない。
ノカルディア科の多くの種は動物に繁殖し、ノカルディア属とロドコッカス属は人間や家畜に感染する恐れがある[8] 。大多数の種はその細胞壁にミコール酸を有しており、抗酸染色で顕微鏡観察すると病原性のマイコバクテリウム属と誤認することがある[9]。
ノカルディア属種は下水処理での活性汚泥に微細な泡を発生させる[10][11][12]。この発泡は下水処理の効率に悪影響を与える。泡の発生を抑える対策として、界面活性剤の投与がある[13][14]。
ノカルディア科は、石油成分などに由来する炭化水素を分解する能力を持つ。このため、分解効率と生育能力が高く、環境影響などの問題がない菌株は、石油流出事故などのためのバイオレメディエーションに利用されることが期待されている[15]。
かつてノカルディア科にはMicropolyspora属が存在していたが、1980年にその属の種はノカルディア科のNocardia属（ノカルディア属）、Streptosporangiaceae科のNonomuraea属、Pseudonocardiaceae科のSaccharopolyspora属にそれぞれ転籍した[16]。
