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Narnaviridae ( Catalan; Valencian )

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Narnaviridae és una família de virus del tipus virus d’ARN monocatenari +.

Gèneres

Abans els Narnaviridae tenien el seu propi grup però actualment són considerats del tipus virus d’ARN monocatenari +.

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Narnaviridae: Brief Summary ( Catalan; Valencian )

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Narnaviridae és una família de virus del tipus virus d’ARN monocatenari +.

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Narnaviridae ( German )

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Narnavirus ist eine Gattung von Einzelstrang-RNA-Viren positiver Polarität in der Familie Narnaviridae. Als natürliche Wirte (zumindest der offiziell bestätigten Mitglieder der Gattung) dienen Pilze, was diese Viren als Mykoviren klassifiziert.[1][3][4]

Es gibt in der Gattung derzeit (Stand 15. Juni 2021) zwei vom International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) offiziell bestätigte Spezies (Arten).[1][3][4] Man hat gezeigt, dass Mitgliedsviren für die sexuelle Fortpflanzung des Schimmelpilzes Rhizopus microsporus erforderlich sind..[5]

Die Narnaviridae haben ein nacktes RNA-Genom ohne Kapsid, d. h. keine echten Virionen (Viruspartikel) und leiten ihren Namen von dieser Eigenschaft ab (englisch naked RNA).[6]

Beschreibung

Aufbau

Narnaviren (im Sinn von Mitgliedern der Gattung Narnavirus) haben kein echtes Virion. Sie haben weder Strukturproteine noch ein Kapsid.[7]

Genome

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Genomkarte von Saccharomyces 20S RNA narnavirus

Das Genom der Narnaviren ist nicht segmentiert (monopartit) und besteht aus einem linearen RNA-Molekül positiver Polarität. Es gibt nur einen Offenen Leserahmen (en. open reading frame, ORF), der für die RNA-abhängige RNA-Polymerase (RdRp) kodiert. Das Genom ist mit der RdRp im Zytoplasma des Wirtspilzes assoziiert und bildet einen nackten Ribonukleoprotein-Komplex.[4]

Replikationszyklus

Die Replikation erfolgt im Zytoplasma. Sie folgt dem üblichen Modell der Replikation positiv-strängiger RNA-Viren; gleiches gilt für die Transkription. Das Virus verlässt die Wirtszelle durch Bewegung von Zelle zu Zelle. Nachgewiesen sind bisher (nur) Pilze als natürliche Wirte (näheres siehe unten). Die Übertragungswege sind vertikal (auf die Nachkommen des Wirts) und sexuell.[4]

Systematik

Innere Systematik

Die Gattung hat (mit Stand 15. Juni 2021) folgende vom ICTV bestätigten Mitgliedsspezies:[3][1]

  • Saccharomyces 20S RNA narnavirus
  • Saccharomyces 23S RNA narnavirus

Weitere vorgeschlagene Spezies nach NCBI sind (Auswahl):[8]

Anmerkung: Die Namensgebungen weisen nicht alle auf Pilze hin. Entweder parasitieren die betreffenden Kandidatenmitglieder andere Eukaryoten (etwa Stechmücken): Bei Genomsequenzen aus der Metagenomik besteht jedoch auch die Möglichkeit, dass sie deswegen mit diesen vergesellschaftet (assoziiert) sind, weil ihr Wirt ein Pilz ist, der mit diesen Tieren, Pflanzen usw. in einer symbiotischen (vielleicht parasitären) Beziehung steht und auf oder in diesen lebt. Diese Frage ist in den betreffenden Fällen daher noch zu klären.[9]

Äußere Systematik

Zwar gibt es mit dem derzeitigen Stand vom 18. Juni 2021 in den Narnaviridae außerhalb der Gattung Narnavirus keine bestätigten Gattungen oder Spezies, das NCBI listet jedoch folgende Kandidaten (Auswahl):[14]

  • Spezies „Aedes japonicus narnavirus 1
  • Spezies „Aedes japonicus narnavirus 1
  • Spezies „Annperkins narna-like virus
  • Spezies „Apple narna-like virus 1
  • Spezies „Apple narna-like virus 2
  • Spezies „Aspergillus lentulus narnavirus 1
  • Spezies „Barns Ness breadcrumb sponge narna-like virus 1“ bis „8
  • Spezies „Botryosphaeria dothidea narnavirus 1
  • Spezies „Botryosphaeria dothidea narnavirus 2
  • Spezies „Botryosphaeria dothidea narnavirus 3
  • Spezies „Botryosphaeria dothidea narnavirus 4
  • Spezies „Botrytis cinerea binarnavirus 1
  • Spezies „Botrytis cinerea binarnavirus 3
  • Spezies „Botrytis cinerea binarnavirus 5
  • Spezies „Culex narnavirus 1
  • Spezies „Cyathus narnavirus A
  • Spezies „Plasmodium vivax Narna-Like virus 1
  • Spezies „Puccinia narnavirus A
  • Spezies „Puccinia narnavirus B
  • Spezies „Puccinia narnavirus C
  • Spezies „Thrips tabaci associated narna-like virus 1
  • Spezies „Thrips tabaci narna-like virus 2

Einzelnachweise

  1. a b c d ICTV: ICTV Master Species List 2020.v1, New MSL including all taxa updates since the 2019 release, March 2021 (MSL #36)
  2. ICTV Master Species List 2018b.v2. MSL #34, März 2019.
  3. a b c Virus Taxonomy: 2020 Release. International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV). March 2021. Abgerufen am 15. Juni 2021.
  4. a b c d Viral Zone. ExPASy. Abgerufen am 15. Juni 2021.
  5. A. N. Espino-Vázquez, J. R. Bermúdez-Barrientos, J. F. Cabrera-Rangel, G. Córdova-López, F. Cardoso-Martínez, A. Martínez-Vázquez, D. A. Camarena-Pozos, S. J. Mondo, T. E. Pawlowska, C. Abreu-Goodger, L. P. Partida-Martínez: Narnaviruses: Novel players in fungal–bacterial symbioses. In: The ISME Journal. 2020. doi:10.1038/s41396-020-0638-y.
  6. Narnaviridae - Positive Sense RNA Viruses - Positive Sense RNA Viruses (2011) - ICTV. In: talk.ictvonline.org. Abgerufen am 15. Juni 2021.
  7. Valerian V. Dolja, Eugene Viktorovich Koonin: Capsid-Less RNA Viruses. In: ELS 2012, ISBN 978-0470016176, doi:10.1002/9780470015902.a0023269.
  8. NCBI: Narnavirus (genus), speziell unclassified Narnavirus (list)
  9. a b c Joseph R. Fauver, Shamima Akter, Aldo Ivan Ortega Morales, William C. Black IV, Americo D. Rodriguez, Mark D. Stenglein, Gregory D. Ebel, James Weger-Lucarelli: A reverse-transcription/RNase H based protocol for depletion of mosquito ribosomal RNA facilitates viral intrahost evolution analysis, transcriptomics and pathogen discovery, in: Virology, Band 528, Februar 2019, S. 181–197, doi:10.1016/j.virol.2018.12.020
  10. Virus-Host DB: Blechmonas luni narnavirus 1
  11. UniProt: Taxonomy - Blechmonas luni narnavirus 1 (Species)
  12. a b NCBI: Blechmonas luni narnavirus 1 (species), NC_040829.1
  13. a b c Danyil Grybchuk, Alexei Y. Kostygov, Diego H. Macedo, Jan Votýpka, Julius Lukeš, Vyacheslav Yurchenko: RNA Viruses in Blechomonas (Trypanosomatidae) and Evolution of Leishmaniavirus, in: ASM mBio, Band 9, 1. Oktober 2018, eissn: 2150-7511, doi:10.1128/mbio.01932-18, PMC 6191543 (freier Volltext), PMID 30327446
  14. NCBI: unclassified Narnaviridae (list)
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Narnaviridae: Brief Summary ( German )

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Narnavirus ist eine Gattung von Einzelstrang-RNA-Viren positiver Polarität in der Familie Narnaviridae. Als natürliche Wirte (zumindest der offiziell bestätigten Mitglieder der Gattung) dienen Pilze, was diese Viren als Mykoviren klassifiziert.

Es gibt in der Gattung derzeit (Stand 15. Juni 2021) zwei vom International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) offiziell bestätigte Spezies (Arten). Man hat gezeigt, dass Mitgliedsviren für die sexuelle Fortpflanzung des Schimmelpilzes Rhizopus microsporus erforderlich sind..

Die Narnaviridae haben ein nacktes RNA-Genom ohne Kapsid, d. h. keine echten Virionen (Viruspartikel) und leiten ihren Namen von dieser Eigenschaft ab (englisch naked RNA).

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Narnaviridae

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Narnavirus is a genus of positive-strand RNA viruses in the family Narnaviridae. Fungi serve as natural hosts. There are two species in this genus.[1][2] Member viruses have been shown to be required for sexual reproduction of Rhizopus microsporus.[3] Narnaviruses have a naked RNA genome without a virion and derive their name from this feature.[4]

Virology

Structure

Narnaviruses have no true virion. They do not have structural proteins or a capsid.[5]

Genome

Narnaviruses have nonsegmented, linear, positive-sense, single-stranded RNA genomes. The genome has one open reading frame which encodes the RNA-dependent RNA polymerase (RdRp). The genome is associated with the RdRp in the cytoplasm of the fungi host and forms a naked ribonucleoprotein complex.[2]

Replication cycle

Viral replication is cytoplasmic. Replication follows the positive-strand RNA virus replication model. Positive-strand RNA virus transcription is the method of transcription. The virus exits the host cell by cell-to-cell movement. Fungi serve as the natural host. Transmission routes are parental and sexual.[2]

Taxonomy

The genus has the following two species:[1]

References

  1. ^ a b "Virus Taxonomy: 2020 Release". International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV). March 2021. Retrieved 16 May 2021.
  2. ^ a b c "Viral Zone". ExPASy. Retrieved 15 June 2015.
  3. ^ Espino-Vázquez AN, Bermúdez-Barrientos JR, Cabrera-Rangel JF, Córdova-López G, Cardoso-Martínez F, Martínez-Vázquez A, Camarena-Pozos DA, Mondo SJ, Pawlowska TE, Abreu-Goodger C, Partida-Martínez LP. (2020). "Narnaviruses: Novel players in fungal–bacterial symbioses". The ISME Journal. 14 (7): 1743–1754. doi:10.1038/s41396-020-0638-y. PMC 7305303. PMID 32269378.{{cite journal}}: CS1 maint: uses authors parameter (link)
  4. ^ "Narnaviridae - Positive Sense RNA Viruses - Positive Sense RNA Viruses (2011) - ICTV". talk.ictvonline.org. Retrieved 15 June 2021.
  5. ^ Dolja, V. V.; Koonin, E. V. (2012). "Capsid-Less RNA Viruses". ELS. doi:10.1002/9780470015902.a0023269. ISBN 978-0470016176.

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Narnaviridae: Brief Summary

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Narnavirus is a genus of positive-strand RNA viruses in the family Narnaviridae. Fungi serve as natural hosts. There are two species in this genus. Member viruses have been shown to be required for sexual reproduction of Rhizopus microsporus. Narnaviruses have a naked RNA genome without a virion and derive their name from this feature.

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Narnaviridae ( Spanish; Castilian )

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Narnaviridae es una familia de virus endosimbiontes mitocondriales de hongos y protistas. No son infecciosos (patógenos).[1]​ Contienen un genoma ARN monocatenario positivo y por lo tanto se incluyen en el Grupo IV de la Clasificación de Baltimore. Incluye un solo género Narnavirus.

Los virus de esta familia no son verdaderos virus y más bien son un tipo de elementos genéticos móviles o replicones compuestos por una cadena de ARN y una RdRP que descienden de bacteriófagos de ARN de la clase Leviviricetes que se integraron en las mitocondrias al momento que se dio la endosimbiosis seriada que dio origen a los eucariotas. Estos virus o replicones parecen haber estado en el eucariota ancestral (LECA) y haberse perdido en la mayoría de los eucariotas.[1]

Los virus de esta familia son estructuralmente similares a los de las familias Botourmiaviridae y Mitoviridae con quienes están estrechamente emparentados y comparten la ausencia de cápside. Además ambos se replican en las mitocondrias en contraposición con otros virus y esta replicación se debe a que el bacteriófago de ARN ancestral perduró infectando a las mitocondrias que eran sus antiguos huéspedes bacterianos.[1]​ También se los describieron como plásmidos de ARN ya que se comportan de manera similar a un plásmido.[2]

Descripción

Los virus de la familia Narnaviridae no forman viriones ya que se tratan de un tipo de elemento genético móvil viral.[1]​ El genoma es lineal con una longitud que varía entre 2.3 y 2.9 kilobases que codifica una proteína de aproximadamente 80 a 104 kDa que forma un complejo de ribonucleoproteína. La segmentación del genoma es tripartita. La replicación se produce en el citoplasma de las mitocondrias. Las rutas de transmisión son por reproducción.[3]

Referencias

  1. a b c d Eugene Koonin, Valerian V Doljja (2014). Virus World as an Evolutionary Network of Viruses and Capsidless Selfish Elements. Microbiology and Molecular Biology Reviews.
  2. Gregory G.Brown, Patrick M.Finnegan (1989). RNA Plasmids. Science Direct.
  3. Narnaviridae. ICTV.
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Narnaviridae: Brief Summary ( Spanish; Castilian )

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Narnaviridae es una familia de virus endosimbiontes mitocondriales de hongos y protistas. No son infecciosos (patógenos).​ Contienen un genoma ARN monocatenario positivo y por lo tanto se incluyen en el Grupo IV de la Clasificación de Baltimore. Incluye un solo género Narnavirus.

Los virus de esta familia no son verdaderos virus y más bien son un tipo de elementos genéticos móviles o replicones compuestos por una cadena de ARN y una RdRP que descienden de bacteriófagos de ARN de la clase Leviviricetes que se integraron en las mitocondrias al momento que se dio la endosimbiosis seriada que dio origen a los eucariotas. Estos virus o replicones parecen haber estado en el eucariota ancestral (LECA) y haberse perdido en la mayoría de los eucariotas.​

Los virus de esta familia son estructuralmente similares a los de las familias Botourmiaviridae y Mitoviridae con quienes están estrechamente emparentados y comparten la ausencia de cápside. Además ambos se replican en las mitocondrias en contraposición con otros virus y esta replicación se debe a que el bacteriófago de ARN ancestral perduró infectando a las mitocondrias que eran sus antiguos huéspedes bacterianos.​ También se los describieron como plásmidos de ARN ya que se comportan de manera similar a un plásmido.​

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Narnaviridae ( French )

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Les Narnaviridae sont une famille de virus à ARN monocaténaire à polarité positive (ssRNA). Les membres de cette famille ne possède pas de capside[4]. Les champignons leur servent d'hôtes naturels. Actuellement, la famille compte sept espèces, réparties entre 2 genres[5],[6]. Ils font également partie des virus nus, parmi lesquels, on retrouve, par exemple, les virus de l'hépatite A et de l'hépatite E.

Virologie

Le génome de ces virus est monocaténaire d'une longueur variant entre 2,3 et 3,5 kilobases. Il code un gène unique, l'ARN polymérase ARN-dépendante. Cette protéine est associée avec le génome dans le cytoplasme de l'hôte[7]. Les virus n'ont pas de capside ou enveloppe et ne forment pas de particules virales infectieuses, à l'exception des vésicules lipidiques[8].

Ils infectent les champignons (y compris les levures) et les oomycètes[9]. Les mitovirus semblent être parmi les virus infectant le plus couramment les champignons[8].

Cycle

La réplication virale est cytoplasmique. La réplication suit le modèle de réplication des virus à ARN à brin positif. La méthode de transcription est celle des virus à ARN à brin positif. Le virus sort de la cellule hôte grâce au mouvement inter-cellulaire. Les champignons leur servent d'hôtes naturels. Les voies de transmission sont parentales et sexuelles[5]

Taxinomie

Deux genres ont été identifiés : les mitovirus, qui infectent les mitochondries des champignons, et les narnavirus, qui restent dans le cytoplasme de la cellule hôte[8].

Leurs plus proches parents parmi les virus à ARN sont des virus infectant les plantes du genre Ourmiavirus, qui, cependant, ont une capside et un certain nombre d'autres protéines. D'autres parents proches sont les bactériophages de la famille des Leviviridae[8].

Références

  • (en) Cet article est partiellement ou en totalité issu de l’article de Wikipédia en anglais intitulé .
  1. ICTV. International Committee on Taxonomy of Viruses. Taxonomy history. Published on the Internet https://talk.ictvonline.org/., consulté le 26 janvier 2021
  2. ICTV. International Committee on Taxonomy of Viruses. Taxonomy history. Published on the Internet https://talk.ictvonline.org/., consulté le 26 janvier 2021
  3. ICTV. International Committee on Taxonomy of Viruses. Taxonomy history. Published on the Internet https://talk.ictvonline.org/., consulté le 26 janvier 2021
  4. (en) V. V. Dolja et E. V. Koonin, ELS, 2012, 14288 p. (ISBN 978-0-470-01617-6 et 0-470-01617-5, DOI ), « Capsid-Less RNA Viruses »
  5. a et b « Viral Zone », ExPASy (consulté le 15 juin 2015)
  6. ICTV, « Virus Taxonomy: 2014 Release » (consulté le 15 juin 2015)
  7. Solorzano A, Rodríguez-Cousiño N, Esteban R, Fujimura T (2000) Persistent yeast single-stranded RNA viruses exist in vivo as genomic RNA. RNA polymerase complexes in 1:1 stoichiometry. J Biol Chem 275(34):26428–35
  8. a b c et d (en) B. I. Hillman et G. Cai, Mycoviruses, vol. 86, Amsterdam/Boston/Paris, Academic Press, coll. « Advances in Virus Research », 2013, 149 p. (ISBN 978-0-12-394315-6, DOI ), « The Family Narnaviridae »
  9. Cai G, Myers K, Fry WE, Hillman BI (2011) A member of the virus family Narnaviridae from the plant pathogenic oomycete Phytophthora infestans. Arch Virol

Référence biologique

Voir aussi

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Narnaviridae: Brief Summary ( French )

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Les Narnaviridae sont une famille de virus à ARN monocaténaire à polarité positive (ssRNA). Les membres de cette famille ne possède pas de capside. Les champignons leur servent d'hôtes naturels. Actuellement, la famille compte sept espèces, réparties entre 2 genres,. Ils font également partie des virus nus, parmi lesquels, on retrouve, par exemple, les virus de l'hépatite A et de l'hépatite E.

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裸露核糖核酸病毒 ( Chinese )

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裸露核糖核酸病毒(Naked RNA Viruses)是一类正链核糖核酸病毒。此类病毒的特点是没有衣壳[1] 自然宿主是真菌。至2015年为止共发现有7个物种,在裸露核糖核酸病毒科下分为两个属。[2][3]

参考资料

  1. ^ Dolja, V. V.; Koonin, E. V. Capsid-Less RNA Viruses. ELS. 2012. ISBN 0470016175. doi:10.1002/9780470015902.a0023269.
  2. ^ Viral Zone. ExPASy. [15 June 2015].
  3. ^ ICTV. Virus Taxonomy: 2014 Release. [15 June 2015].
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裸露核糖核酸病毒: Brief Summary ( Chinese )

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裸露核糖核酸病毒(Naked RNA Viruses)是一类正链核糖核酸病毒。此类病毒的特点是没有衣壳, 自然宿主是真菌。至2015年为止共发现有7个物种,在裸露核糖核酸病毒科下分为两个属。

裸露核糖核酸病毒科(Narnaviridae) 裸露核糖核酸病毒屬(Narnavirus) 線粒體病毒屬(Mitovirus)
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