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Ampullaviridae

Ampullaviridae ( German )

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Ampullaviridae ist die Bezeichnung einer Familie von Viren mit einem linearen Doppelstrang-DNA-Genom, die Archaeen der Gattung Acidianus ([en], Crenarchaeota) infizieren.[2] Bisher ist vom International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) nur die einzige Gattung Ampullavirus in dieser Familie bestätigt, und diese mit nur einer Spezies (Art): Acidianus bottle-shaped virus.[3]

Der Name der Familie und der Gattung ist vom lateinischen Wort für Flasche, ampulla, abgeleitet, da die Virionen die Form einer Flasche haben. Die Familie wurde erstmals bei einer Untersuchung der mikrobiellen Flora von heißen Quellen in Italien beschrieben.

Aufbau und Genom

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Negativ-Kontrast.EM-Aufnahme von ursprünglichen (links) und teilweise degradierten Virionen von ABV. Rechts unten Schemazeichnung nach Häring et al. (2005).[2][4][Anm. 1]

Ampullaviren haben eine sehr spezifische Morphologie. Die Virionen (Virusteilchen) sind flaschenförmig mit einem schmalen Ende auf der einen Seite, wobei sich die Gestalt zum anderen Ende fließend erweitert. Die Gesamtlänge beträgt etwa 230 nm bei einer Breite (am weiten Ende) von etwa 75 nm. Das schmale Ende ragt über die Virushülle hinaus und dient wahrscheinlich der Injektion der viralen DNA in Wirtszellen. Das breite Ende besitzt etwa 20 dünne Filamente, die regelmäßig in einem Ring verteilt sind. Im Inneren der Hülle befindet sich eine trichterförmige Proteinhülle, die die virale DNA beherbergt.[2]

Das Genom der Ampullaviren ist unsegmentiert (monopartit) und besteht aus einem linearen doppelsträngigen DNA-Molekül mit einer Länge von etwa 23,8 kbp (Kilobasenpaaren). Es enthält schätzungsweise 56 oder 57 offene Leserahmen (en. Open Reading Frames, ORFs), die für mindestens sechs Strukturproteine kodieren.[2][5]

Reproduktionszyklus

Die virale Replikation erfolgt im Zytoplasma der Wirtszelle. Der Eintritt in die Wirtszelle erfolgt nach die Anheftung des Virus an die Wirtszelle. Die Transkription erfolgt durch Ablesen des dsDNA-Genoms (en. DNA templated transcription). Als natürlicher Wirt dienen Archaeen der Gattung Acidianus. (Crenarchaeota) Die Übertragung der Virusteilchen geschieht durch passive Diffusion.[6][7]

Systematik

Die innere Systematik der Familie ist mit Stand 18. März 2021 nach ICTV und NCBI wie folgt (vorgeschlagene Taxa in doppelten Anführungszeichen):

Familie: Ampullaviridae

  • Gattung: Ampullavirus
    • Spezies: Acidianus bottle-shaped virus (ABV, Typus)
    • Spezies: Acidianus bottle-shaped virus 2 (ABV2)[8]
    • Spezies: Acidianus bottle-shaped virus 3 (ABV3)[9]

Bezüglich der äußeren Systematik schlugen Kim et al. (2019) folgendes Kladogramm vor (vereinfacht):[10][11]



Ovaliviridae



Podoviridae: Picovirinae


Tectiviridae (monoderm hosts: Gram-positive Bakterien)




Tectiviridae (diderm hosts: Gram-negative Bakterien)


Autolykiviridae[12][13]






Ampullaviridae



Thaspiviridae: Nitmarvirus (Stämme Nitrosopumilus spindle-shaped virus 1,2 und 3; NSV1–3)[14][15]



Halspiviridae: Salterprovirus (His 1 virus)


Pleolipoviridae: Gammapleolipovirus (His 2 virus)






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Anmerkungen

  1. Das Material wurde von dieser Quelle kopiert, die unter einer Creative Commons Attribution 4.0 International License verfügbar ist.

Einzelnachweise

  1. a b c d e f ICTV: ICTV Master Species List 2019.v1, New MSL including all taxa updates since the 2018b release, March 2020 (MSL #35)
  2. a b c d Monika Häring, R. Rachel, X. Peng, R. A. Garrett, D. Prangishvili: Viral diversity in hot springs of Pozzuoli, Italy, and characterization of a unique archaeal virus, Acidianus bottle-shaped virus, from a new family, the Ampullaviridae. In: Journal of Virology. 79, Nr. 15, 2005, S. 9904–9911. doi:10.1128/JVI.79.15.9904-9911.2005. PMID 16014951. PMC 1181580 (freier Volltext).
  3. D Prangishvili, M Krupovic, ICTV Report Consortium: ICTV Virus Taxonomy Profile: Ampullaviridae.. In: The Journal of General Virology. 99, Nr. 3, 8. Februar 2018, S. 288–289. doi:10.1099/jgv.0.001023. PMID 29458532. PMC 5882107 (freier Volltext).
  4. Andrew M. Kropinski, Stuart G. Siddell: ICTV Online Report/ampullaviridae Ampullaviridae, Genus: Ampullavirus (ICTV)
  5. X. Peng, T. Basta, M. Häring, R. A. Garrett, D. Prangishvili: Genome of the Acidianus bottle-shaped virus and insights into the replication and packaging mechanisms. In: Virology. 364, Nr. 1, 2007, S. 237–243. doi:10.1016/j.virol.2007.03.005. PMID 17412384.
  6. ICTV Online Report Ampullaviridae. Abgerufen am 2. Mai 2020.
  7. Viral Zone. ExPASy. Abgerufen am 2. Mai 2020.
  8. Acidianus bottle-shaped virus 2 (species). NCBI.
  9. Acidianus bottle-shaped virus 3 (species). NCBI
  10. Jong-Geol Kim, So-Jeong Kim, Virginija Cvirkaite-Krupovic, Woon-Jong Yu, Joo-Han Gwak, Mario López-Pérez, Francisco Rodriguez-Valera, Mart Krupovic, Jang-Cheon Cho, Sung-Keun Rhee: Spindle-shaped viruses infect marine ammonia-oxidizing thaumarchaea. In: PNAS, Band 116, Nr. 31, 30. Juli 2019, S. 15645–15650; doi:10.1073/pnas.1905682116, ResearchGate, Epub 16. Juli 2019.
  11. Jong-Geol Kim, Mart Krupovic, Sung-Keun Rhee: Thaspiviridae Proposal 2019.092B (ZIP-Member 2019.092B.A.v1.Thaspiviridae_1nfam.docx), 2019 – accepted
  12. Scientists Find New Type of Virus in World’s Oceans: Autolykiviridae, auf: sci-news vom 25. Januar 2018
    Forscher entdecken ein mysteriöses Virus, das die Ozeane dominiert, auf: business insider vom 29. Januar 2018
    Never-Before-Seen Viruses With Weird DNA Were Just Discovered in The Ocean. sciencealert, 25. Januar 2018
    David L. Chandler: Researchers Discover a Missing Link in Virus Evolution, auf: SciTechDaily vom 25. Januar 2018
  13. Autolykiviridae (family). NCBI
  14. ICTV Taxonomy history: Nitmarvirus NSV1. ICTV, EC 51, Berlin, Germany, July 2019; Email ratification March 2020 (MSL #35)
  15. ICTV Master Species List 2020.v1. ICTV, New MSL including all taxa updates since the 2019 release, March 2021 (MSL #36)
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Ampullaviridae: Brief Summary ( German )

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Ampullaviridae ist die Bezeichnung einer Familie von Viren mit einem linearen Doppelstrang-DNA-Genom, die Archaeen der Gattung Acidianus ([en], Crenarchaeota) infizieren. Bisher ist vom International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) nur die einzige Gattung Ampullavirus in dieser Familie bestätigt, und diese mit nur einer Spezies (Art): Acidianus bottle-shaped virus.

Der Name der Familie und der Gattung ist vom lateinischen Wort für Flasche, ampulla, abgeleitet, da die Virionen die Form einer Flasche haben. Die Familie wurde erstmals bei einer Untersuchung der mikrobiellen Flora von heißen Quellen in Italien beschrieben.

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Ampullaviridae

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Ampullaviridae is a family of viruses that infect archaea of the genus Acidianus.[1] Only one genus in this family has been described, Bottigliavirus, which contains three species.[2][3] The name of the family and genus is derived from the Latin word for bottle, ampulla, due to the virions having the shape of a bottle. The family was first described during an investigation of the microbial flora of hot springs in Italy.

Taxonomy

The family contains one genus, which has three species:[2]

  • Genus: Bottigliavirus, previously named Ampullavirus[4]
    • Bottigliavirus ABV, previously named Acidianus bottle-shaped virus[5]
    • Bottigliavirus ABV2
    • Bottigliavirus ABV3

Structure and genome

Ampullaviruses have unique morphology, with the virions being bottle-shaped with one narrow end that smoothly expands into a wider end for an overall length of about 230 nm and width of about 75 nm at the broad end. The narrow end projects beyond the viral envelope and is likely used to inject the viral DNA into host cells. The broad end possesses about 20 thin filaments, each that are regularly distributed in a ring. Inside the envelope is a funnel-shaped protein coat that houses the viral DNA.[1]The genome of ampullaviruses is linear, double-stranded DNA that is about 23.8 kilobases in length. The genome contains an estimated 56 or 57 open reading frames that encode for at least six structural proteins.[1][6]

Life cycle

Viral replication is cytoplasmic. Entry into the host cell is achieved by virus attaches to host cell. DNA-templated transcription is the method of transcription. Archaea of the genus Acidianus serve as the natural host. Transmission routes are passive diffusion.[7][8]

References

  1. ^ a b c Häring, M; Rachel, R; Peng, X; Garrett, R. A.; Prangishvili, D (2005). "Viral diversity in hot springs of Pozzuoli, Italy, and characterization of a unique archaeal virus, Acidianus bottle-shaped virus, from a new family, the Ampullaviridae". Journal of Virology. 79 (15): 9904–11. doi:10.1128/JVI.79.15.9904-9911.2005. PMC 1181580. PMID 16014951.
  2. ^ a b "Virus Taxonomy: 2020 Release". International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV). March 2021. Retrieved 23 May 2021.
  3. ^ Prangishvili, D; Krupovic, M; ICTV Report Consortium (8 February 2018). "ICTV Virus Taxonomy Profile: Ampullaviridae". The Journal of General Virology. 99 (3): 288–289. doi:10.1099/jgv.0.001023. PMC 5882107. PMID 29458532.
  4. ^ "ICTV Taxonomy history: Bottigliavirus". International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV). Retrieved 23 May 2021.
  5. ^ "ICTV Taxonomy history: Bottigliavirus ABV". International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV). Retrieved 23 May 2021.
  6. ^ Peng, X; Basta, T; Häring, M; Garrett, R. A.; Prangishvili, D (2007). "Genome of the Acidianus bottle-shaped virus and insights into the replication and packaging mechanisms". Virology. 364 (1): 237–43. doi:10.1016/j.virol.2007.03.005. PMID 17412384.
  7. ^ "ICTV Online Report Ampullaviridae". Retrieved 2 May 2020.
  8. ^ "Viral Zone". ExPASy. Retrieved 2 May 2020.

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Ampullaviridae: Brief Summary

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Ampullaviridae is a family of viruses that infect archaea of the genus Acidianus. Only one genus in this family has been described, Bottigliavirus, which contains three species. The name of the family and genus is derived from the Latin word for bottle, ampulla, due to the virions having the shape of a bottle. The family was first described during an investigation of the microbial flora of hot springs in Italy.

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Ampullaviridae ( Spanish; Castilian )

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Ampullaviridae es una familia de virus de ADN que infectan arqueas. Incluye dos géneros. El nombre de la familia y el género se deriva del latín "ampulla" botella, debido a que los viriones tienen forma de botella. Los primeros especímenes fueron descritos por primera vez durante una investigación de la flora microbiana en aguas termales de Italia.[1][2]

Géneros

Contiene los siguientes dos géneros:

Descripción

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Virión de los ampulavirus.

Los ampulavirus tienen una morfología única, los viriones en forma de botella con un extremo estrecho que se expande suavemente en un extremo más ancho para una longitud total de aproximadamente 230 nm y un ancho de aproximadamente 75 nm en el extremo ancho. Los viriones poseen una envoltura viral. El extremo estrecho se proyecta más allá de la envoltura viral y probablemente se usa para inyectar el ADN viral en las células huésped. El extremo ancho posee unos 20 filamentos delgados, cada uno de los cuales se distribuye regularmente en un anillo. Dentro de la envoltura viral hay una capa de proteínas en forma de embudo (extrañas y sin homólogos) que albergan el ADN viral.[2][3]

El genoma de los ampulavirus es lineal de ADN bicatenario de aproximadamente 23,8 kilobases de longitud. El genoma contiene un estimado de 56 o 57 marcos de lectura abiertos que codifican al menos seis proteínas estructurales del virión.[2][3]

La replicación viral se produce en el citoplasma. La entrada en la célula huésped se logra mediante la adhesión del virus a la célula huésped. La transcripción con plantilla de ADN es el método de transcripción. Las arqueas sirven como huésped natural. Las rutas de transmisión son por difusión pasiva.[2][3]

La forma del virión no tiene ninguna relación conocida con otros virus. Sin embargo, algunos otros virus de arqueas también tienen formas inusuales, lo que puede indicar que dicha morfología es una forma antigua que no está representada entre los virus que infectan eucariotas y otros procariotas.[4]

Referencias

  1. Häring, M; Rachel, R; Peng, X; Garrett, R. A.; Prangishvili, D (2005). «Viral diversity in hot springs of Pozzuoli, Italy, and characterization of a unique archaeal virus, Acidianus bottle-shaped virus, from a new family, the Ampullaviridae». Journal of Virology 79 (15): 9904-11. PMC 1181580. PMID 16014951. doi:10.1128/JVI.79.15.9904-9911.2005.
  2. a b c d Prangishvili, D; Krupovic, M; ICTV Report Consortium (8 February 2018). «ICTV Virus Taxonomy Profile: Ampullaviridae.». The Journal of General Virology 99 (3): 288-289. PMC 5882107. PMID 29458532. doi:10.1099/jgv.0.001023.
  3. a b c Peng, X; Basta, T; Häring, M; Garrett, R. A.; Prangishvili, D (2007). «Genome of the Acidianus bottle-shaped virus and insights into the replication and packaging mechanisms». Virology 364 (1): 237-43. PMID 17412384. doi:10.1016/j.virol.2007.03.005.
  4. David Prangishvili. Archaeal viruses: living fossils of the ancient virosphere Archivado el 25 de mayo de 2021 en Wayback Machine..
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Ampullaviridae: Brief Summary ( Spanish; Castilian )

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Ampullaviridae es una familia de virus de ADN que infectan arqueas. Incluye dos géneros. El nombre de la familia y el género se deriva del latín "ampulla" botella, debido a que los viriones tienen forma de botella. Los primeros especímenes fueron descritos por primera vez durante una investigación de la flora microbiana en aguas termales de Italia.​​

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