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Alloherpesviridae

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Alloherpesviridae is a family of viruses in the order Herpesvirales. This family includes the species that infect fish and amphibians. Phylogenetic studies have confirmed the validity of this family and suggest that it may be divided into two clades: one consisting of viruses from cyprinid and anguillid hosts and the other of viruses from ictalurid, salmonid, acipenserid, and ranid hosts.[1] There are currently 13 species in this family, divided among four genera. A disease associated with this family includes channel catfish disease.[2][3]

Taxonomy

Alloherpesviridae was established as a family in 2005.

Genera

The family contains the following four genera:[3]

Structure

Viruses in Alloherpesviridae are enveloped, with icosahedral and spherical to pleomorphic geometries, and T=16 symmetry. The diameter is around 150–200 nm. Genomes are linear and non-segmented, around 134-248kb in length. [2]

Life cycle

Viral replication is nuclear, and is lysogenic. Entry into the host cell is achieved by attachment of the viral glycoproteins to host receptors, which mediates endocytosis. DNA-templated transcription is the method of transcription. Fish serve as the natural host. Transmission routes are passive diffusion.[2]

Genomics

Several genomes have been sequenced.[4] Cyprinid herpesviruses 1, 2 and 3 (CyHV1, CyHV2 and CyHV3) cause disease in common carp, goldfish and koi. Their genomes are 291144, 290304 and 295146 base pairs in size. The overall organisation common to all three and consists of a unique central region flanked by a direct repeat at each end. 137, 150, and 155 unique, functional protein coding genes are present in the unique regions: of these six, four, and eight are duplicated in the terminal repeat. The genomes share 120 orthologous genes in a largely colinear arrangement. Up to 55 of these latter genes are also conserved in the other member of Cyprinivirus; Anguillid herpesvirus 1. CyHV1, CyHV2, and CyHV3 have five, six and five families of paralogous genes.

References

  1. ^ Waltzek TB, Kelley GO, Alfaro ME, Kurobe T, Davison AJ, Hedrick RP (2009). "Phylogenetic relationships in the family Alloherpesviridae". Dis. Aquat. Org. 84 (3): 179–94. doi:10.3354/dao02023. PMID 19565695.
  2. ^ a b c "Viral Zone". ExPASy. Retrieved 12 June 2015.
  3. ^ a b "Virus Taxonomy: 2019 Release". talk.ictvonline.org. International Committee on Taxonomy of Viruses. Retrieved 9 May 2020.
  4. ^ Davison AJ, Kurobe T, Gatherer D, Cunningham C, Korf I, Fukuda H, Hedrick RP, Waltzek TB (2013). "Comparative genomics of carp herpesviruses". J. Virol. 87 (5): 2908–22. doi:10.1128/JVI.03206-12. PMC 3571366. PMID 23269803.
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Alloherpesviridae: Brief Summary

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Alloherpesviridae is a family of viruses in the order Herpesvirales. This family includes the species that infect fish and amphibians. Phylogenetic studies have confirmed the validity of this family and suggest that it may be divided into two clades: one consisting of viruses from cyprinid and anguillid hosts and the other of viruses from ictalurid, salmonid, acipenserid, and ranid hosts. There are currently 13 species in this family, divided among four genera. A disease associated with this family includes channel catfish disease.

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Alloherpesviridae ( French )

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Alloherpesviridae est une famille de virus appartenant à l'ordre des Herpesvirales. Cette famille comprend des espèces qui infectent les poissons et les amphibiens. Cette famille peut être divisée en deux clades: l'un composé de virus ayant pour hôtes les cyprinidés (poisson d'eau douce) et anguillidés (poissons serpentiformes) et l'autre de virus ayant pour hôtes les ictaluridés (poissons-chats), salmonidés (saumons), acipenseridés (esturgeons) et ranidés[1]. Il existe actuellement 13 espèces dans cette famille, réparties en quatre genres. Cette famille provoque notamment la maladie du poisson-chat[2],[3].

Taxonomie

Alloherpesviridae a été établie en tant que famille en 2005.

Genres

Cette famille contient les quatre genres suivants[3]:

  • Batrachovirus
  • Cyprinivirus
  • Ictalurivirus
  • Salmonivirus

Références

  • (en) Cet article est partiellement ou en totalité issu de l’article de Wikipédia en anglais intitulé .
  1. « Phylogenetic relationships in the family Alloherpesviridae », Dis. Aquat. Org., vol. 84, no 3,‎ 2009, p. 179–94 (PMID , DOI )
  2. « Viral Zone », ExPASy (consulté le 8 octobre 2021)
  3. a et b « Virus Taxonomy: 2019 Release », talk.ictvonline.org, International Committee on Taxonomy of Viruses (consulté le 9 mai 2020)
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Alloherpesviridae: Brief Summary ( French )

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Alloherpesviridae est une famille de virus appartenant à l'ordre des Herpesvirales. Cette famille comprend des espèces qui infectent les poissons et les amphibiens. Cette famille peut être divisée en deux clades: l'un composé de virus ayant pour hôtes les cyprinidés (poisson d'eau douce) et anguillidés (poissons serpentiformes) et l'autre de virus ayant pour hôtes les ictaluridés (poissons-chats), salmonidés (saumons), acipenseridés (esturgeons) et ranidés. Il existe actuellement 13 espèces dans cette famille, réparties en quatre genres. Cette famille provoque notamment la maladie du poisson-chat,.

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Alloherpesviridae ( Italian )

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Gli Alloherpesviridae sono una famiglia di virus a dsDNA facente parte dell'ordine Herpesvirales, del regno Heunggongvirae.[1]

Morfologia

I virioni sono di forma sferica, dotati di involucro all'interno del quale vi sono due strati di tegumento (tegumento esterno e tegumento interno) che racchiudono il capside. Il virione ha un raggio che va da 120 a 200 nm ed è dotato di proteine di superficie sporgenti. Il tegumento non presenta una struttura riconoscibile, è formato da proteine disposte spesso in maniera asimmetrica. Il capside, formato da 162 capsomeri, ha un diametro di 100-110 nm e simmetria icosaedrica[2].

Genoma

Il genoma è costituito da una singola molecola di DNA a doppio filamento lunga 120-220 kbp, ancorata alle pareti interne del capside. Il contenuto guanina+citosina è variabile a seconda della specie dal 35% al 75%[2].

Replicazione

Il virus si replica nelle cellule dei vertebrati. Ogni specie virale infetta un singolo ospite. Il virus sfrutta recettori superficiali della cellula ospite per fondere l'involucro con la membrana cellulare e rilasciare nel citoplasma il capside e le proteine del tegumento. Attraverso i pori nucleari, il capside viene trasportato nel nucleo, dove viene rilasciato il DNA. I primi geni trascritti servono a promuovere la trascrizione di ulteriori geni virali da parte della RNA polimerasi II dell'ospite. Le proteine così prodotte vengono riportate nel nucleo e servono per la replicazione del DNA. Dopo la sintesi di numerose copie del genoma virale, vengono trascritti i geni tardivi, che codificano per le proteine strutturali e per altre. Anche queste proteine vengono riportate nel nucleo, dove le particelle virali vengono assemblate. I virioni così formati attraversano la membrana nucleare, modificata da alcune glicoproteine virali, l'apparato di Golgi e la membrana cellulare[3].

In alcuni casi il genoma virale si può integrare in quello dell'ospite e rimanere latente replicandosi come episoma insieme al DNA cellulare[3].

Tassonomia

La famiglia virale è divisa in quattro generi e 13 specie riconosciute[1]:

Note

  1. ^ a b Virus Taxonomy: 2019 Release, su talk.ictvonline.org, International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV), luglio 2019. URL consultato il 9 giugno 2020.
  2. ^ a b (EN) ICTVdb, su ictvdb.bio-mirror.cn. URL consultato il 14 novembre 2020 (archiviato dall'url originale il 6 marzo 2013).
  3. ^ a b ViralZone, su viralzone.expasy.org, 6 dicembre 2011 (archiviato dall'url originale il 14 dicembre 2013).

Bibliografia

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Alloherpesviridae: Brief Summary ( Italian )

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Gli Alloherpesviridae sono una famiglia di virus a dsDNA facente parte dell'ordine Herpesvirales, del regno Heunggongvirae.

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