Raoultella ist eine Gattung gramnegativer Bakterien aus der Familie der Enterobacteriaceae. Benannt wurde sie nach dem französischen Bakteriologen Didier Raoult. Raoultella ist mit der Gattung Klebsiella verwandt, die vor 2001 bekannten Raoultella-Arten waren ursprünglich zu dieser Gattung gestellt.
Die Zellen von Raoultella-Arten sind Stäbchenbakterien, die nicht aktiv beweglich sind, da sie keine Flagellen besitzen. In der Gram-Färbung verhalten sich die Zellen gramnegativ, werden also durch die verwendeten Farbstoffe rosa bis rot angefärbt. Die Bakterienzellwand ist von einer Kapsel umgeben, die aus Polysacchariden besteht.[1]
Die Angehörigen der Gattung Raoultella sind chemoorganotroph, d. h., sie bauen zur Energiegewinnung organische Stoffe ab. Sie sind fakultativ anaerob: Wenn Sauerstoff vorhanden ist, können sie einen oxidativen Energiestoffwechsel durchführen; wenn kein Sauerstoff vorhanden ist, also unter anoxischen Bedingungen, nutzen viele Vertreter der Gattung die 2,3-Butandiol-Gärung zur Energiegewinnung. Dieses Merkmal wird zur Unterscheidung der Enterobacteriaceae-Gattungen im Voges-Proskauer-Test genutzt.[2] Wie bei den Enterobacteriaceae typisch, verlaufen der Katalase-Test positiv und der Oxidase-Test negativ.[1]
Für die Kultivierung sind Nährmedien mit einem Zusatz von Fleischextrakt geeignet. Raoultella-Arten sind mesophil, optimales Wachstum erfolgt in einem Temperaturbereich von 30–37 °C. Im Gegensatz zu den Arten von Klebsiella wachsen Raoultella schon bei 10 °C.[1]
Der GC-Gehalt, also der Anteil der Nukleinbasen Guanin und Cytosin in der Bakterien-DNA, liegt bei 55–58 Molprozent.[3]
Raoultella-Arten weisen in ihren Membranlipiden v. a. die folgenden Fettsäureketten auf: 21–28 % Palmitinsäure (eine gesättigte Fettsäure mit der Abkürzung C16:0), 21–25 % cis-Vaccensäure (eine einfach ungesättigte Omega-n-Fettsäure – in diesem Fall Omega-7-Fettsäure – mit der Abkürzung C18:1 (ω−7)c) sowie 17–28 % eines in der Analyse nicht trennbaren Gemisches aus cis-Palmitoleinsäure (eine Omega-7-Fettsäure mit der Abkürzung C16:1 (ω−7)c) und/oder 2-Hydroxy-iso-Pentadecansäure (systematischer Name: 2-Hydroxy-13-methyltetradecansäure, Abkürzung iso-C15:0 2-OH; hierbei handelt es sich um eine verzweigtkettige Fettsäure, die neben der Methylgruppe (–CH3), die die Verzweigung darstellt, noch die Besonderheit aufweist, dass sie mit insgesamt 15 C-Atomen zu den ungeradzahligen Fettsäuren gehört und wegen der Hydroxygruppe (–OH) zu den α-Hydroxycarbonsäuren gezählt wird).[3]
2001 erfolgte aufgrund der Ergebnisse phylogenetischer Untersuchungen die Auftrennung der bis dahin bekannten Gattung Klebsiella in die Gattungen Klebsiella und Raoultella, dabei wurden drei Spezies in die neue Gattung gestellt. Der Gattungsname stellt ein Eponym dar, das den französischen Bakteriologen Didier Raoult ehrt.[1]
Die Gattung besteht aus folgenden Spezies (Stand September 2020), R. planticola ist die Typusart.[4]
Natürliche Habitate der Vertreter der Gattung sind Gewässer, Erdboden und Pflanzen,[1] letzteres ist beispielsweise im artspezifischen Epitheton R. planticola aufgenommen, es bedeutet in etwa „Pflanzenbewohner“.[4] Gelegentlich findet man die Bakterien auch auf der Schleimhaut von Säugetieren, einschließlich des Menschen.[1] R. electrica wurde erstmals aus dem Biofilm an der Anode einer mit Glucose betriebenen Brennstoffzelle isoliert.[3]
Raoultella ist eine Gattung gramnegativer Bakterien aus der Familie der Enterobacteriaceae. Benannt wurde sie nach dem französischen Bakteriologen Didier Raoult. Raoultella ist mit der Gattung Klebsiella verwandt, die vor 2001 bekannten Raoultella-Arten waren ursprünglich zu dieser Gattung gestellt.
The genus Raoultella is composed of Gram-negative, oxidase-negative, aerobic, nonmotile, capsulated, facultatively anaerobic rods (formerly designated Klebsiella) in the family Enterobacteriaceae. It is named after the French bacteriologist Didier Raoult.[1][2][3] The existence of this genus renders the genus Klebsiella paraphyletic, and it has been repeatedly proposed to consider Raoultella a junior synonym of Klebsiella.
Members of genus Raoultella grow at 10 °C consistent with their recovery from plants, soil, and water, whereas members of Klebsiella do not grow at 10 °C[4] and are mainly recovered from mammals' mucosae. Klebsiella oxytoca is an exception, and a proposal to classify K. oxytoca in a separate, unnamed genus has been made.[5]
It consists of species Raoultella electrica, Raoultella ornithinolytica, Raoultella planticola and Raoultella terrigena.[6]
In human infections, Raoultella species are generally sensitive to treatment with carbapenems. In one series, 92% were sensitive to ciprofloxacin. More than 10% produced extended-spectrum beta-lactamases.[7]
Type species for this genus are:
A phylogenetic tree of Klebsiella, based on a 2.93-Mbp alignment, unambiguously places R. ornithinolytica sister to K. oxytoca within the larger Klebsiella phylogeny and suggests abandoning the genus Raoultella designation.[13]
Robust phylogenetic analyses have repeatedly shown that species classified into this genus are nested in the genus Klebsiella, indicating Raoultella should be abandoned and considered a junior synonym of Klebsiella.[14][15][16][17]
In November 2021, the synonym Klebsiella electrica is reported "not validly published".[18] The correct name with a valid nomenclatural status is Raoultella electrica.[9]
{{cite book}}: CS1 maint: others (link) The genus Raoultella is composed of Gram-negative, oxidase-negative, aerobic, nonmotile, capsulated, facultatively anaerobic rods (formerly designated Klebsiella) in the family Enterobacteriaceae. It is named after the French bacteriologist Didier Raoult. The existence of this genus renders the genus Klebsiella paraphyletic, and it has been repeatedly proposed to consider Raoultella a junior synonym of Klebsiella.
Raoultella es un género de bacterias Gram negativas, oxidasa negativas, aeróbicas, móviles, capsuladas y anaerobias facultativas (anteriormente designadas como Klebsiella) en la familia Enterobacteriaceae. Su nombre es en honor del microbiólogo francés Didier Raoult.[1] Su validez como género es discutida por no ser probablemente monofilético y se ha sugerido su reunificación con Klebsiella.[2][3]
El crecimiento de estas bacterias ocurre a 10 °C, consistente con el hecho de que se pueden encontrar a nivel de plantas, suelo y agua.
Raoultella es un género de bacterias Gram negativas, oxidasa negativas, aeróbicas, móviles, capsuladas y anaerobias facultativas (anteriormente designadas como Klebsiella) en la familia Enterobacteriaceae. Su nombre es en honor del microbiólogo francés Didier Raoult. Su validez como género es discutida por no ser probablemente monofilético y se ha sugerido su reunificación con Klebsiella.
Raoultella est un genre de bactéries de la famille des Enterobacteriaceae et de la classe gamma-protéobactéries. Ubiquitaires dans l'environnement naturel, ces bactéries sont également des pathogènes opportunistes ou émergents. Le genre Raoultella est très proche du genre Klebsiella dont il a été séparé en 2001 et sa légitimité reste débattue au sein de la communauté scientifique.
Les bactéries de ce genre sont des bâtonnets gram négatifs, oxydase négatives, catalase positives, aérobies (anaérobies facultatives), non motiles, capsulés[1]. La croissance à 10 °C est une des caractéristiques de ce genre[1].
Dans les infections humaines, les espèces de Raoultella sont généralement sensibles au traitement par les carbapénèmes[2].
De nombreuses études ont montré que le genre Klebsiella était polyphylétique[3],[4] et de ce fait a subi de nombreuses modifications taxonomiques[5],[6]. En 2001, Michel Drancourt, Claude Bollet, Anne Carta et Patricia Rousselier, du laboratoire de bactériologie de l'hôpital de la Timone décrivent le genre Raoultella en y plaçant trois espèces du genre Klebsiella sur des critères phylogénétiques, biochimiques et phénotypiques[1],[7],[8]. Le nom de ce nouveau genre a été validé en 2001 puis accepté conditionnellement en 2005[9],[10] sous réserve d'études de séquençages complémentaires[11]. En 2007, le conseil d'administration de la Taxonomie des Bactéries et Archae a validé la nouvelle combinaison[12] et les banques de cultures bactériennes ont pu commencer à appliquer les nouvelles dénominations.
En 2014, une nouvelle espèce, Raoultella electrica est ajoutée par Kimura et al.[13].
En novembre 2021, après la proposition de Ma et al., la reclassification de R. electrica en Klebsiella electrica est considérée « publiée de manière non valide[14] ». Par ailleurs, au 29 mars 2022, le statut de correct name est conservé uniquement pour le genre Raoultella pour ce qui concerne les 4 espèces de ce genre[7].
Lors de sa description, le genre Raoultella (Ra.oul.tel′la. M.L. dim. suffixe -ella ; M.L. fem. n. Raoultella) a été nommé d'après le bactériologiste français Didier Raoult[7],[1].
En 2001, des analyses phylogénétiques d'espèces du genre Klebsiella, ainsi que d'espèces parmi d'autres genres de la famille des Enterobacteriaceae, et portant sur deux gènes de référence en taxonomie (l'ARNr 16S et rpoB) révèlent que le genre Klebsiella est hétérogène[1]. Ce genre est alors scindé en deux et le genre Raoultella créé, intégrant les espèces K. ornithinolytica, K. planticola, K. trevisanii (synonyme de K. planticola) et K. terrigena[1]. Une autre étude phylogénétique portant sur les gènes gyrA et parC, publiée en parallèle dans le même journal confirme l'hétérogénéité du genre Klebsiella où « les données des séquences supportent la séparation évolutive de K. pneumoniae d'un groupe phylogénétique incluant K. oxytoca, Klebsiella planticola et Klebsiella ornithinolytica[15]. »
En 2005, un séquençage des gènes tuf et atpD sur 96 souches d'entérobactéries d'intérêt clinique représentant 78 espèces de 31 genres confirme la séparation des Klebsiella et des Raoultella en plusieurs clusters distincts[16]. Les auteurs précisent que les Raoultella ont probablement divergé récemment[16]. Ces résultats sont confirmés par une nouvelle phylogénie basée sur l'AFLP[17].
En 2009, une nouvelle étude basée sur le séquençage des gènes de l'ARNr 16S et rpoB incluant l'ensemble des espèces de Klebsiella et de Raoultella connues à cette date confirme « la bifurcation des arbres laquelle confirme la séparation des genres Raoultella et Klebsiella[18]. »
En 2014, une nouvelle analyse phylogénétique basée sur le gène de l'ARNr 16S mais incluant l'ensemble des espèces et tous les genres de la famille des Enterobacteriaceae différencie le genre Raoultella des Klebsiella, et conclut que « [...] Providencia, Raoultella [...] sont regroupées dans un seul cluster (chacune) [...] et donc sont très certainement monophylétiques », alors que « sept genres [...] Escherichia, Klebsiella [...] sont certainement polyphylétiques[5] » avec les Klebsiella séparées en trois groupes[5],[19]. Les auteurs de cette étude analysent la polyphylie des Klebsiella en expliquant que lors de sa description « l'assignation taxonomique (de K. michiganensis) semblait robuste mais exposait le problème de ne pas inclure suffisamment d'autres espèces et genres pour s'assurer de l'identité de genre de la nouvelle espèce[5]. » Cette même année, une autre étude phylogénétique des klebsielles montre que R. ornithinolytica est située à proximité de l'arbre phylogénétique de klebsielles, sur une branche proche de K. oxytoca. Dans cette étude, les auteurs concluent que le genre Raoultella devrait être abandonné au profit d'un genre Klebsiella avec une définition large[20].
Le logiciel de diagnostic médical BIBI classe les Raoultella dans un cluster distinct mais à proximité de celui des Klebsiella pneumoniae qui sont elles-mêmes séparées du cluster des Klebsiella oxytoca par celui du genre Klyuvera[21]. La réunification des espèces du genre Raoultella avec Klebsiella est explicitement demandée à nouveau par Ma et al. en juin 2021 (« we propose to reunify Klebsiella and Raoultella to the single genus Klebsiella and reclassify Raoultella electrica as Klebsiella electrica comb. nov. »)[22]. Cependant d'autres analyses phylogénétiques dont celle de la base Genome Taxonomy Database[23], base intégrée avec le Bergey's Manual of Systematic Bacteriology comme faisant autorité pour les génomes bactériens, concluent, dès 2018 et aussi en 2021, au maintien des Raoultella et à la présence de deux groupes génomiques distincts pour les Klebsiella[23],[24],[22]. Au 29 mars 2022, la proposition n'est pas retenue par l'ICSP, et la base LPSN (qui fait autorité en nomenclature bactérienne) maintient le statut de correct name au genre Raoultella[14].
Les espèces pour ce genre sont :
Les Raoultella sont occasionnellement retrouvées dans les muqueuses de mammifères, dont celles de l'Homme, mais les habitats naturels les plus importants sont les plans d'eau, l'eau potable, le sol et les plantes[1]. Ce dernier habitat est d'ailleurs à l'origine du nom de l'espèce Raoultella planticola, dont l'épithète spécifique planticola signifie « habitant des plantes »[32].
Raoultella planticola peut causer diverses infections, telles que la fasciite nécrosante, la cystite, la cholécystite, la pancréatite, les maladies hépatiques et les infections des tissus mous[40]. Entre 2011 et 2015, au moins quatre cas de conjonctivite causées par Raoultella planticola ont été signalées[41].
Raoultella terrigena est un pathogène opportuniste rare, qui peut provoquer des infections nosocomiales avec un taux de mortalité élevé[42].
L'espèce Raoultella ornithinolytica a été impliquée dans des cas de septicémies néonatale ainsi que chez chez des adultes[43],[44].
Raoultella est un genre de bactéries de la famille des Enterobacteriaceae et de la classe gamma-protéobactéries. Ubiquitaires dans l'environnement naturel, ces bactéries sont également des pathogènes opportunistes ou émergents. Le genre Raoultella est très proche du genre Klebsiella dont il a été séparé en 2001 et sa légitimité reste débattue au sein de la communauté scientifique.
