The western clawed frog (Xenopus tropicalis) is a species of frog in the family Pipidae, also known as tropical clawed frog.[2] It is the only species in the genus Xenopus to have a diploid genome.[3][4] Its genome has been sequenced,[5][6] making it a significant model organism for genetics that complements the related species Xenopus laevis (the African clawed frog),[7] a widely used vertebrate model for developmental biology. X. tropicalis also has a number of advantages over X. laevis in research, such as a much shorter generation time (<5 months), smaller size (4–6 cm (1.6–2.4 in) body length), and a larger number of eggs per spawn.[8]
It is found in Benin, Burkina Faso, Cameroon, Ivory Coast, Equatorial Guinea, Gambia, Ghana, Guinea, Guinea-Bissau, Liberia, Nigeria, Senegal, Sierra Leone, Togo, and possibly Mali. Its natural habitats are subtropical or tropical moist lowland forests, moist savanna, rivers, intermittent rivers, swamps, freshwater lakes, intermittent freshwater lakes, freshwater marshes, intermittent freshwater marshes, rural gardens, heavily degraded former forests, water storage areas, ponds, aquaculture ponds, and canals and ditches.
The western clawed frog is a medium-sized species with a somewhat flattened body and a snout-vent length of 28 to 55 mm (1.1 to 2.2 in), females being larger than males. The eyes are bulging and situated high on the head and there is a short tentacle just below each eye. A row of unpigmented dermal tubercles runs along the flank from just behind the eye, and are thought to represent a lateral line organ. The limbs are short and plump, and the fully webbed feet have horny claws. The skin is finely granular. The dorsal surface varies from pale to dark brown and has small grey and black spots. The ventral surface is dull white or yellowish with some dark mottling.[9]
The western clawed frog is an aquatic species and is found in the West African rainforest belt with a range stretching from Senegal to Cameroon and eastern Zaire. It is generally considered a forest-dwelling species and inhabits slow-moving streams, but it is also found in pools and temporary ponds in the northern Guinea and Sudan savannas.[9]
In the dry season, this frog lives in shallow streams and hides under tree roots, under flat stones, or in holes in the riverbank. It feeds primarily on earthworms, insect larvae and tadpoles. When the rainy season starts it migrates across the forest floor at night to find temporary pools. Spawning may take place in large pools with much vegetation, but tadpoles are also sometimes found in muddy pools with no vegetation. Single eggs may be attached to plants or they may float. The tadpoles have broad mouths and no jaws, but have long tentacles on their upper lips. The ventral fins of their tails are broader than the dorsal ones. Their body colour is generally orange and the tail transparent but in darker locations the tail may be blackish. The tadpoles feed by filtering zooplankton from the water. In large water bodies, they may form dense swarms. Metamorphosis takes place when the tadpoles measure about 5 cm (2 in) in length.[9]
Sex determination in the vast majority of amphibians is controlled by homomorphic (morphologically indistinguishable) sex chromosomes.[10] As a result of this difficulty in sex chromosome identification, only a relatively small proportion of anuran species that have been karyotyped have also had their sex chromosomes identified.[11] Of the species in the genus Xenopus, all have homomorphic sex chromosomes.[11] Additionally, the DM-W gene on the W chromosome in some Xenopus species is the only sex-determining gene that has been identified in amphibians.[11] This DM-W gene was first identified in X. laevis, however it is not found in X. tropicalis.[11] Experimentation involving sex-reversed individuals, gynogenesis, triploids, and conventional crosses, has determined that X. tropicalis has three sex chromosomes: Y, W, and Z.[11] These three sex chromosomes produce three different male genotypes, YW, YZ, and ZZ (all are phenotypically identical) and two different female genotypes, ZW, and WW (all are phenotypically identical).[11] As a result, offspring of X. tropicalis can have sex ratios that differ from the commonly known 1:1 usually found in species with only two different sex chromosomes. For example, offspring resulting from a ZW female and a YZ male will have a sex ratio of 1:3 females to males and offspring resulting from a WW female and a ZZ male will be all female.[11] As a result of this sex determination system, both male and female X. tropicalis can be either heterogametic or homogametic which is extremely rare in nature.[11] The exact genetic mechanism and the exact alleles underlying this system is not yet known.[12] One possible explanation is that the W chromosome contains a female-determining allele that has function that is not found on the Z chromosome while the Y chromosome contains an allele that acts a negative regulator that is dominant over the female-determining allele on the W chromosome.[12]
Although X. tropicalis does have these three sex chromosomes, the frequency of these three sex chromosomes is not evenly distributed among this species' populations throughout its natural range. The Y chromosome has been identified from two localities in Ghana and in a laboratory strain that originated in Nigeria and the Z chromosome has been confirmed to exist in individuals from western and eastern Ghana.[12] Additionally, all three sex chromosomes have been found to exist together in X. tropicalis populations in Ghana and potentially elsewhere in its range as well.[12] Additionally, having irregular sex ratios in offspring is generally thought to be disadvantageous so whether or not the existence of three sex chromosomes in X. tropicalis is evolutionarily stable or an indication that the species is going through a sex chromosome transition (turnover), is still a question.[12] It seems likely that the emergence of the Y chromosome is the most recent event in the evolution of this species' sex chromosomes.[12] It is possible that in the future extinction of the Z chromosome would make it so that the W chromosome transitions into a X chromosome making this species with sex determined by an XY system.[12] It is also possible that if the Y chromosome were to go extinct, this species will have reverted to using an ancestral ZW system.[12]
The IUCN lists the western clawed frog as "Least Concern" because it has a wide distribution and is an adaptable species living in a range of habitats, and the population trend seems to be steady.[1]
Xenopus embryos and eggs are a popular model system for a wide range of biomedical research.[3][13] This animal is widely used because of its powerful combination of experimental tractability and close evolutionary relationship with humans, at least compared to many model organisms.[13]
Unlike its sister species X. laevis, X. tropicalis is diploid and has a short generation time, facilitating genetic studies.[3] The complete genome of X. tropicalis has been sequenced.[5] This species has n=10 chromosomes.[14]
X. tropicalis has three transferrin genes, all of which are close orthologs of other vertebrates. They are relatively far from non-vertebrate chordates, and widely divergent from protostome orthologs.[15]
Xenbase[16] is the Model Organism Database (MOD) for both Xenopus laevis and Xenopus tropicalis.[17]
The western clawed frog (Xenopus tropicalis) is a species of frog in the family Pipidae, also known as tropical clawed frog. It is the only species in the genus Xenopus to have a diploid genome. Its genome has been sequenced, making it a significant model organism for genetics that complements the related species Xenopus laevis (the African clawed frog), a widely used vertebrate model for developmental biology. X. tropicalis also has a number of advantages over X. laevis in research, such as a much shorter generation time (
Xenopus tropicalis[2] es una especie de anfibio anuro de la familia Pipidae.
Esta especie se encuentra en África occidental: Senegal, Gambia, Guinea-Bissau, Guinea, Sierra Leona, Liberia, Burkina Faso, Costa de Marfil, Ghana, Togo, Benín , en Nigeria, en la isla de Bioko en Guinea Ecuatorial y en Camerún.[3]
El genoma de Xenopus tropicalis contiene 10 pares de cromosomas. A diferencia de Xenopus laevis, Xenopus tropicalis es diploide. El genoma contiene alrededor de 1.7 mil millones de pares de bases y aproximadamente 24,000 genes. El genoma ha terminado de ser secuenciado en 2010.
Silurana tropicalis Silurana generoko animalia da. Anfibioen barruko Pipidae familian sailkatuta dago, Anura ordenan.
Xenopus tropicalis est une espèce d'amphibiens de la famille des Pipidae[1]. Ces crapauds griffus à peau lisse vivent dans des étangs et des mares en Afrique tropicale.
Cette espèce se rencontre en Afrique de l'Ouest : au Sénégal, en Gambie, en Guinée-Bissau, en Guinée, au Sierra Leone, au Liberia, au Burkina Faso, en Côte d'Ivoire, au Ghana, au Togo, au Bénin, au Nigeria, sur l'île de Bioko en Guinée équatoriale et en Cameroun[1],[2].
Le génome de Xenopus tropicalis contient 10 paires de chromosomes. Contrairement à Xenopus laevis, Xenopus tropicalis est diploïde. Le génome contient environ 1,7 milliard de paires de bases et environ 24 000 gènes. Le génome a fini d'être séquencé en 2010[3].
Xenopus tropicalis est une espèce d'amphibiens de la famille des Pipidae. Ces crapauds griffus à peau lisse vivent dans des étangs et des mares en Afrique tropicale.
Xenopus tropicalis é unha especie de anfibio da familia Pipidae.[2] É a única especie do xénero Xenopus que ten un xenoma diploide.[3][4] O seu xenoma foi secuenciado,[5][6] o que o converteu nun importante organismo modelo para estudos xenéticos, que complementa os xa feitos na especie emparentada Xenopus laevis,[7] tradicionalmente moi utilizada como organismo modelo vertebrado en bioloxía do desenvolvemento. X. tropicalis ten tamén varias vantaxes sobre X. laevis para a investigación, como un tempo de xeración moito máis curto (<5 meses), un menor tamaño (ten unha lonxitude de 4 a 6 cm), e pon un maior número de ovos durante o desove.[8]
É unha especie acuática que se encontra nas selvas de África occidental desde Senegal a Camerún e polo leste ata a República Democrática do Congo. Considérase xeralmente unha especie que habita bosques húmidos e vive en correntes de auga lentas, pero tamén se atopa en lagoas e pozas temporais nas sabanas do norte de Guinea e Sudán.[9]
É unha especie de medio tamaño cun corpo aplanado e unha lonxitude do extremo da cabeza á cloaca de 28 a 55 mm, e as femias son meirandes que os machos. Os ollos sobresaen bastante do corpo e están situados no alto da cabeza e teñen un curto tentáculo xusto detrás de cada ollo. Presentan unha ringleira de tubérculos dérmicos non pigmentados que discorren ao longo dos flancos desde detrás dos ollos, e que se cre representan o órgano da liña lateral. As patas son curtas e gordechas, e os seus pés traseiros presentan membrana interdixital completa e teñen uñas córneas. A pel é finalmente granular. A superficie dorsal varía de marrón escura a clara e ten pequenas manchas grises e negras. A superficie ventral é branca clara ou amarelada con algunhas manchiñas escuras.[9]
Encóntrase en África tropical occidental en Benín, Burkina Faso, Camerún, Costa do Marfil, Guinea Ecuatorial, Gambia, Ghana, Guinea, Guinea-Bissau, Liberia, Nixeria, Senegal, Serra Leoa, Togo, e posiblemente Mali. Hai tamén informes da súa presenza en Angola e Sudán. En xeral, nas zonas ao leste considérase que é substituído pola especie Xenopus epitropicalis. Os seus hábitats naturais son os bosques de terras baixas húmidos tropicais e subtropicais, sabanas húmidas, ríos permanentes ou intermitentes, pantanos, lagos de auga doce permanentes ou intermitentes, zonas húmidas de auga doce permanentes ou intermitentes, xardíns rurais, bosques moi degradados, áreas de almacenamento de auga, lagoas, estanques de acuicultura, e canais e regos.
Na estación seca este anfibio vive en regatos pouco profundos e agóchase baixo as raíces das árbores, baixo pedras planas, ou en buratos na ribeira dos ríos. Aliméntase principalmente de miñocas de terra, larvas de insectos e cágados. Cando empeza a estación chuviosa migra a través do chan do bosque pola noite para atopar algunha lagoa temporal. O desove pode ter lugar en grandes lagoas con moita vexetación, pero os cágados poden atoparse tamén ás veces en lagoas lamacentas sen vexetación. Cada ovo pode ser adherido a plantas ou pode flotar. Os cágados teñen bocas moi grandes sen mandíbulas (son filtradores), pero con longos tentáculos no beizo superior. As aletas ventrais das colas son máis amplas do que as dorsais. A cor do seu corpo é xeralmente laranxa e a cola é transparente pero nos hábitats máis escuros pode ser dun ton tirando a negro. Os cágados aliméntanse por filtración do zooplancto da auga. En corpos de auga grandes, poden formar densos grupos. A metamorfose ten lugar cando os cágados miden arredor de 5 cm de lonxitude.[9]
Nas listas da IUCN está especie ten un status de "Pouco preocupante", porque ten unha ampla distribución, é moi adaptable e pode vivir nunha gama ampla de hábitats, e as súas poboacións son estables.[1]
Os embrións e ovos de Xenopus son un sistema moi utilizdo para facer estudos de investigación biomédica,[3][10] porque son moi manexables nos experimentos e ten unha maior relación evolutiva cos humanos que outras especies modelo.[10]
A diferenza da súa especie relacionada X. laevis, que é tetraploide, X. tropicalis é diploide e ten un curto tempo de xeración, o que facilita os estudos.[3] The complete genome of X. tropicalis has been sequenced [5]
Xenbase é a base de datos de organismo modelo tanto para Xenopus laevis coma para Xenopus tropicalis.[11]
Xenopus tropicalis é unha especie de anfibio da familia Pipidae. É a única especie do xénero Xenopus que ten un xenoma diploide. O seu xenoma foi secuenciado, o que o converteu nun importante organismo modelo para estudos xenéticos, que complementa os xa feitos na especie emparentada Xenopus laevis, tradicionalmente moi utilizada como organismo modelo vertebrado en bioloxía do desenvolvemento. X. tropicalis ten tamén varias vantaxes sobre X. laevis para a investigación, como un tempo de xeración moito máis curto (
Xenopus tropicalis é uma espécie de rã da família Pipidae. É a única espécie do género Xenopus com um genoma diplóide.[2] O seu genoma foi sequenciado em 2010,[3] sendo o primeiro genoma de um anfíbio a ser sequenciado,[4] o que o torna um organismo modelo importante para a genética que complementa a espécie relacionada Xenopus laevis,[5] que é bastante usado como um modelo de vertebrado pela biologia do desenvolvimento. X. tropicalis tem uma série de vantagens sobre X. laevis para a investigação, tal como menor tempo de geração (desova.[6]
Xenopus tropicalis é uma espécie de rã da família Pipidae. É a única espécie do género Xenopus com um genoma diplóide. O seu genoma foi sequenciado em 2010, sendo o primeiro genoma de um anfíbio a ser sequenciado, o que o torna um organismo modelo importante para a genética que complementa a espécie relacionada Xenopus laevis, que é bastante usado como um modelo de vertebrado pela biologia do desenvolvimento. X. tropicalis tem uma série de vantagens sobre X. laevis para a investigação, tal como menor tempo de geração (
Xenopus tropicalis là một ếch thuộc họ Pipidae, tiếng Anh thường gọi là Tropical clawed frog hoặc Silurana tropicalis. Đây là loài duy nhất thuộc chi Xenopus to have a diploid genome.[2] Hệ gen của nó đã được sắp xếp theo trình tự[3], làm cho nó một ý nghĩa mô hình sinh vật di truyền bổ sung các loài có liên quan Xenopus laevis[4], một mô hình động vật có xương sống được sử dụng rộng rãi cho kinh học phát triển. X. tropicalis cũng có một số ưu điểm hơn X. laevis trong nghiên cứ, như thời gian thế hệ ngắn hớn (<5 tháng, kích cỡ nhỏ hơn (4–6 cm chiều dài cơ thể), và số trứng mỗi lứa nhiều hơn.[5]
Loài này có ở Bénin, Burkina Faso, Cameroon, Bờ Biển Ngà, Guinea Xích Đạo, Gambia, Ghana, Guinea, Guinea-Bissau, Liberia, Nigeria, Senegal, Sierra Leone, Togo, và có thể cả Mali. Môi trường sống tự nhiên của chúng là rừng ẩm vùng đất thấp nhiệt đới hoặc cận nhiệt đới, xavan ẩm, sông ngòi, sông có nước theo mùa, đầm nước, hồ nước ngọt, hồ nước ngọt có nước theo mùa, đầm nước ngọt, đầm nước ngọt có nước theo mùa, vườn nông thôn, rừng trước đây suy thoái nghiêm trọng, khu vực trữ nước, ao, ao nuôi trồng thủy sản, và kênh đào và mương rãnh.
Xenopus tropicalis là một ếch thuộc họ Pipidae, tiếng Anh thường gọi là Tropical clawed frog hoặc Silurana tropicalis. Đây là loài duy nhất thuộc chi Xenopus to have a diploid genome. Hệ gen của nó đã được sắp xếp theo trình tự, làm cho nó một ý nghĩa mô hình sinh vật di truyền bổ sung các loài có liên quan Xenopus laevis, một mô hình động vật có xương sống được sử dụng rộng rãi cho kinh học phát triển. X. tropicalis cũng có một số ưu điểm hơn X. laevis trong nghiên cứ, như thời gian thế hệ ngắn hớn (
熱帶爪蟾（学名：Xenopus tropicalis）是負子蟾科下的一種青蛙。牠們是爪蟾屬下唯一擁有二倍體基因組的[1]，且已被DNA序列[2]，補充了非洲爪蟾成為遺傳學上的模式生物。[3]
